52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2256 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  58.44 
 
 
877 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  58.44 
 
 
877 aa  828    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  100 
 
 
883 aa  1714    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  74.46 
 
 
885 aa  1121    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  58.44 
 
 
877 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  55.23 
 
 
875 aa  754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  36.08 
 
 
1051 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  48.02 
 
 
877 aa  161  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  33.21 
 
 
874 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 
880 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  26.73 
 
 
881 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  25.91 
 
 
892 aa  95.9  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.29 
 
 
917 aa  89.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  32.24 
 
 
901 aa  79  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  33.52 
 
 
910 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  23.85 
 
 
875 aa  75.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  35.94 
 
 
946 aa  75.1  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  26.53 
 
 
870 aa  73.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.44 
 
 
873 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  31.02 
 
 
878 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  37.41 
 
 
880 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  22.21 
 
 
918 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  32.07 
 
 
880 aa  64.3  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  32.5 
 
 
875 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  33.65 
 
 
874 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  31.58 
 
 
878 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  33.17 
 
 
874 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  31.93 
 
 
888 aa  54.7  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.36 
 
 
711 aa  52  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32.99 
 
 
821 aa  51.6  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  31.52 
 
 
812 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  42.11 
 
 
619 aa  50.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.02 
 
 
634 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  33.9 
 
 
1282 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  47.92 
 
 
478 aa  48.5  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  44.64 
 
 
606 aa  48.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.43 
 
 
875 aa  47.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  33.59 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.83 
 
 
615 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  42.86 
 
 
604 aa  47  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  38.24 
 
 
830 aa  47  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  40.91 
 
 
978 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  38.6 
 
 
529 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  37.14 
 
 
1351 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  27.06 
 
 
647 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  32.03 
 
 
1157 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  40.35 
 
 
598 aa  45.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  30.84 
 
 
1080 aa  45.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  37.7 
 
 
1157 aa  44.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.57 
 
 
1194 aa  45.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 
1023 aa  44.7  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  36.67 
 
 
1158 aa  44.3  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>