60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1763 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 880 aa  1750    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  29.46 
 
 		 875 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  29.09 
 
 		 880 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  30.36 
 
 		 874 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  30.95 
 
 		 874 aa  277  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  29.3 
 
 		 878 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  26.8 
 
 		 878 aa  244  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  27.61 
 
 		 875 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  31.35 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.57 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  30.38 
 
 		 881 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  28.81 
 
 		 873 aa  132  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  40.56 
 
 		 875 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  41.29 
 
 		 870 aa  115  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  32.84 
 
 		 888 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  21.45 
 
 		 901 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  37.67 
 
 		 874 aa  86.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30 
 
 		 877 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.37 
 
 		 877 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30 
 
 		 877 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  28.29 
 
 		 892 aa  85.1  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  38 
 
 		 877 aa  83.2  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  23.27 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.27 
 
 		 910 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  26.3 
 
 		 885 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  31.58 
 
 		 875 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  27.84 
 
 		 883 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1051 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  25.41 
 
 		 946 aa  57.4  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1282 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  41.79 
 
 		 1351 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.81 
 
 		 979 aa  52  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  27.52 
 
 		 821 aa  51.2  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  22.04 
 
 		 978 aa  50.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.41 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  22.04 
 
 		 978 aa  50.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.8 
 
 		 994 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 711 aa  49.7  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.8 
 
 		 724 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1137 aa  49.7  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  33.33 
 
 		 888 aa  48.9  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  28.36 
 
 		 1234 aa  48.5  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1284 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.85 
 
 		 723 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  31.97 
 
 		 784 aa  47.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1354 aa  47.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1280 aa  47.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3310  SMC domain protein  29.37 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  20.66 
 
 		 1019 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  26.62 
 
 		 818 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  23.33 
 
 		 922 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  24.33 
 
 		 926 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  29.53 
 
 		 922 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  30.91 
 
 		 891 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  24.87 
 
 		 917 aa  45.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  33.7 
 
 		 664 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  24.11 
 
 		 955 aa  45.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1181 aa  44.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1194 aa  44.3  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>