41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1688 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  100 
 
 
892 aa  1704    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  27.89 
 
 
901 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  36 
 
 
875 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  31.22 
 
 
880 aa  96.3  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  30.46 
 
 
881 aa  84.7  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  28.29 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  31.41 
 
 
880 aa  77.4  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  32.91 
 
 
888 aa  71.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  31.13 
 
 
878 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  30.35 
 
 
875 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  31.71 
 
 
883 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  39.36 
 
 
874 aa  68.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.27 
 
 
935 aa  68.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  32.44 
 
 
874 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  27.59 
 
 
870 aa  65.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.22 
 
 
873 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  26.58 
 
 
877 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  22.59 
 
 
918 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  34.02 
 
 
874 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  25.13 
 
 
917 aa  62  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  26.79 
 
 
875 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  45.26 
 
 
1051 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.72 
 
 
895 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.58 
 
 
877 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30.58 
 
 
877 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  20.3 
 
 
891 aa  57.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30.58 
 
 
877 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  30 
 
 
910 aa  56.2  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  27.85 
 
 
994 aa  56.6  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  27.33 
 
 
711 aa  56.6  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  34.44 
 
 
885 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  29.9 
 
 
955 aa  50.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  21.13 
 
 
859 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  31.66 
 
 
875 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 
1164 aa  48.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  24.41 
 
 
852 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 
1019 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  24.41 
 
 
852 aa  46.6  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 
339 aa  44.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  27.76 
 
 
1047 aa  44.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  44.9 
 
 
650 aa  44.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>