78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2302 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 880 aa  1675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  38.06 
 
 		 875 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  35 
 
 		 881 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  31.69 
 
 		 880 aa  324  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  30.99 
 
 		 878 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  31.28 
 
 		 875 aa  201  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  38.74 
 
 		 880 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  31.38 
 
 		 873 aa  135  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  29.59 
 
 		 878 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  34.16 
 
 		 888 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  31.04 
 
 		 874 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  37.5 
 
 		 874 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  43.44 
 
 		 870 aa  100  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  27.25 
 
 		 901 aa  98.2  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  31.22 
 
 		 892 aa  97.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.81 
 
 		 875 aa  91.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  30.83 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  32.22 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30.41 
 
 		 877 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.41 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30.41 
 
 		 877 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.46 
 
 		 918 aa  67.8  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  30.94 
 
 		 910 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  32.07 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  30.06 
 
 		 917 aa  64.7  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  31.93 
 
 		 875 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  36.69 
 
 		 712 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  32 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  29.2 
 
 		 917 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1282 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.86 
 
 		 926 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  31 
 
 		 877 aa  53.5  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  31.37 
 
 		 1057 aa  52  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  41.25 
 
 		 1199 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  41.25 
 
 		 1199 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  32.58 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  31.88 
 
 		 922 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  41.25 
 
 		 1199 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 		 1200 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  30.43 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  35.37 
 
 		 1201 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  42.37 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  42.37 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  42.37 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  41.25 
 
 		 1198 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  35.79 
 
 		 1046 aa  48.9  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  44.9 
 
 		 1115 aa  48.5  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  38.37 
 
 		 1175 aa  48.9  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  42 
 
 		 1232 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  44.07 
 
 		 1234 aa  48.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.21 
 
 		 1176 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  37.21 
 
 		 1176 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1194 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  44.07 
 
 		 1177 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1354 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  44.07 
 
 		 1227 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  32 
 
 		 1291 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1157 aa  46.2  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1351 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  32.79 
 
 		 1318 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  28.57 
 
 		 1208 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  40.38 
 
 		 1194 aa  46.2  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  42.37 
 
 		 1191 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  25 
 
 		 617 aa  45.8  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.23 
 
 		 891 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  24 
 
 		 664 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1277 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  31.52 
 
 		 1047 aa  45.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  42.37 
 
 		 1176 aa  45.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  42.86 
 
 		 1199 aa  45.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1176 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1348 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  31.58 
 
 		 1170 aa  45.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  31.97 
 
 		 1307 aa  44.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 1280 aa  44.3  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  35.37 
 
 		 1192 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.91 
 
 		 813 aa  44.3  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>