61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13301 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  100 
 
 		 918 aa  1852    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 917 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.75 
 
 		 910 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  39.62 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  31.38 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  34.81 
 
 		 873 aa  68.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  33.99 
 
 		 880 aa  67.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  35.34 
 
 		 1074 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  27.92 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  27.92 
 
 		 877 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  27.92 
 
 		 877 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  34.96 
 
 		 875 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  38.1 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  32.21 
 
 		 875 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  36.26 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  30.71 
 
 		 901 aa  59.7  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  29.45 
 
 		 883 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  33.08 
 
 		 880 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  50 
 
 		 987 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  31.85 
 
 		 874 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  30.53 
 
 		 885 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  31.91 
 
 		 874 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.01 
 
 		 789 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  30.2 
 
 		 875 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  31.25 
 
 		 880 aa  56.2  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  47.92 
 
 		 987 aa  55.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  28.4 
 
 		 993 aa  54.7  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1280 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  22.59 
 
 		 892 aa  52.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  28.12 
 
 		 993 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1284 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  37.33 
 
 		 711 aa  52.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  37.66 
 
 		 994 aa  52  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  29.68 
 
 		 883 aa  51.6  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.38 
 
 		 787 aa  51.2  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  28.12 
 
 		 993 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  43.75 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  32.05 
 
 		 922 aa  49.7  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  32.05 
 
 		 922 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  33.65 
 
 		 881 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1354 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1155 aa  48.9  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  31.87 
 
 		 812 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.53 
 
 		 802 aa  48.5  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  33.06 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  44 
 
 		 862 aa  48.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 870 aa  48.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  30 
 
 		 890 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1351 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  24.18 
 
 		 917 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.44 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1194 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1186 aa  46.2  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.38 
 
 		 978 aa  45.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.91 
 
 		 902 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 821 aa  45.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  30.93 
 
 		 891 aa  44.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  25.52 
 
 		 806 aa  44.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  39.58 
 
 		 1021 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.06 
 
 		 1049 aa  44.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  37.66 
 
 		 570 aa  44.3  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>