54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1226 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  100 
 
 		 875 aa  1748    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  37.62 
 
 		 878 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.26 
 
 		 880 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  34.49 
 
 		 874 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  34.18 
 
 		 874 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.61 
 
 		 880 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  28.11 
 
 		 875 aa  191  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  33.6 
 
 		 878 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  25 
 
 		 901 aa  140  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.59 
 
 		 917 aa  102  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  34.81 
 
 		 880 aa  88.2  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.55 
 
 		 881 aa  78.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  47.06 
 
 		 888 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  26.52 
 
 		 892 aa  68.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  26.57 
 
 		 873 aa  65.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  26.26 
 
 		 875 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  34.71 
 
 		 870 aa  63.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  28.07 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  30.77 
 
 		 874 aa  62.4  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  24.19 
 
 		 875 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  26.27 
 
 		 946 aa  55.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  33 
 
 		 1137 aa  52.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1157 aa  51.6  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1351 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  36 
 
 		 968 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  34.33 
 
 		 883 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1155 aa  49.3  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1160 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.35 
 
 		 729 aa  49.7  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  47.22 
 
 		 1348 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1354 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  33.06 
 
 		 918 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  30.08 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  42 
 
 		 712 aa  48.5  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  34.25 
 
 		 917 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  29.25 
 
 		 974 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.78 
 
 		 1171 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  29.25 
 
 		 974 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  25.98 
 
 		 1163 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  29.25 
 
 		 974 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  29.25 
 
 		 974 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  29.25 
 
 		 767 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  29.25 
 
 		 974 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  30.21 
 
 		 1178 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  29.25 
 
 		 767 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 973 aa  46.2  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1282 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1284 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  26.73 
 
 		 1167 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  28.3 
 
 		 974 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  28.3 
 
 		 974 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  40 
 
 		 595 aa  44.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  34.21 
 
 		 1173 aa  44.3  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>