120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2437 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 1277 aa  2338    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1348 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1186 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  40.61 
 
 		 1181 aa  105  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1149 aa  104  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1157 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  42.04 
 
 		 1155 aa  102  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.32 
 
 		 1171 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1160 aa  98.2  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1181 aa  97.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1185 aa  96.3  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1153 aa  95.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1144 aa  90.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1156 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1156 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1158 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  37.16 
 
 		 1153 aa  89.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1153 aa  89  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1156 aa  89  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  31.2 
 
 		 1167 aa  88.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1210 aa  86.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1156 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1351 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1157 aa  86.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  25.68 
 
 		 1163 aa  85.1  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1126 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1126 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1151 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1156 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1167 aa  82.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1152 aa  82.4  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  36.31 
 
 		 1179 aa  81.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1127 aa  78.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1065 aa  76.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1155 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1284 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1156 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1156 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1152 aa  70.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1201 aa  69.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1047 aa  67.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1282 aa  65.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  31.88 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  21.29 
 
 		 974 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  29.71 
 
 		 188 aa  64.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  21.72 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1280 aa  61.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  21.29 
 
 		 974 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  21.83 
 
 		 974 aa  60.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.89 
 
 		 968 aa  60.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1354 aa  59.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  34.97 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  24.56 
 
 		 974 aa  58.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  21.02 
 
 		 974 aa  58.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  30.97 
 
 		 812 aa  58.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  20.86 
 
 		 974 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  26.55 
 
 		 978 aa  57.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  26.55 
 
 		 978 aa  57.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  21.29 
 
 		 767 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.38 
 
 		 723 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  21.29 
 
 		 767 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  23.98 
 
 		 974 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  44.44 
 
 		 712 aa  54.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  23.39 
 
 		 877 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  28.21 
 
 		 711 aa  52.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0638  protein lsr2 precursor  74.19 
 
 		 117 aa  52.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  28.93 
 
 		 830 aa  51.6  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  45.45 
 
 		 595 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  30 
 
 		 883 aa  51.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  42.67 
 
 		 115 aa  51.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1179 aa  51.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  40 
 
 		 1173 aa  50.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1467 aa  50.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3128  hypothetical protein  77.78 
 
 		 116 aa  50.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  34 
 
 		 1185 aa  50.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 		 406 aa  49.7  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  32 
 
 		 973 aa  50.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1184 aa  49.7  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3498  putative Lsr2-like protein  62.5 
 
 		 113 aa  49.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.494087  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1245  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  62.5 
 
 		 113 aa  49.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  57.14 
 
 		 111 aa  48.9  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  45.28 
 
 		 113 aa  48.9  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  52.5 
 
 		 119 aa  48.5  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2925  hypothetical protein  74.07 
 
 		 116 aa  48.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.150841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13630  iron-regulated lsr2 protein precursor  67.74 
 
 		 112 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.5800500000000003e-77  normal  0.0370238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1403 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1137 aa  48.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  35.38 
 
 		 1188 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6765  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  62.5 
 
 		 113 aa  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  42.37 
 
 		 1511 aa  47.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0722  hypothetical protein  62.86 
 
 		 111 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201789  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  38.33 
 
 		 1081 aa  47.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4757  Lsr2  64.52 
 
 		 113 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212965  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  38.36 
 
 		 109 aa  47.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5143  Lsr2  64.52 
 
 		 113 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  38.98 
 
 		 1165 aa  47  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  59.38 
 
 		 113 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  38.33 
 
 		 1263 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  34.18 
 
 		 1115 aa  47.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1186 aa  47  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>