101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5507 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  100 
 
 		 1160 aa  2295    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1167 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  29.17 
 
 		 1171 aa  343  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  29.06 
 
 		 1163 aa  313  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1149 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1210 aa  297  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  28.58 
 
 		 1186 aa  292  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  28.69 
 
 		 1167 aa  292  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1153 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1185 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  44.25 
 
 		 1127 aa  139  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1156 aa  139  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1153 aa  134  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1156 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1156 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1156 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  40.41 
 
 		 1179 aa  134  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1156 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1156 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1156 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1153 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1157 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1151 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  40 
 
 		 1155 aa  114  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1152 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1152 aa  109  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1181 aa  108  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1157 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  105  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  34.66 
 
 		 1155 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  41.21 
 
 		 1181 aa  100  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1348 aa  99  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1144 aa  99  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  40.1 
 
 		 1201 aa  95.1  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  34.26 
 
 		 1126 aa  94.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  42.76 
 
 		 1158 aa  93.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1277 aa  91.3  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1284 aa  90.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1126 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.53 
 
 		 812 aa  89.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1282 aa  81.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1065 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1351 aa  80.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1280 aa  78.2  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.17 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1047 aa  73.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.64 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1354 aa  71.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.99 
 
 		 830 aa  70.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  27.5 
 
 		 877 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  34.97 
 
 		 768 aa  70.1  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.45 
 
 		 821 aa  69.7  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.24 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  26.62 
 
 		 974 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  28.3 
 
 		 974 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.88 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  24.86 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  28.3 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.5 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.37 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.89 
 
 		 978 aa  66.6  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.89 
 
 		 978 aa  66.6  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1467 aa  66.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  40.48 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  27.45 
 
 		 973 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  41.12 
 
 		 711 aa  64.3  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1414 aa  62.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  35.65 
 
 		 883 aa  62.4  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  27.67 
 
 		 199 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  27.67 
 
 		 199 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.48 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.92 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.48 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  29.69 
 
 		 922 aa  60.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  24.37 
 
 		 968 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  28.91 
 
 		 922 aa  59.3  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.09 
 
 		 664 aa  57.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  34.41 
 
 		 719 aa  56.2  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  29.37 
 
 		 881 aa  55.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  41.43 
 
 		 880 aa  55.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  29.27 
 
 		 917 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  33.78 
 
 		 875 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  37.14 
 
 		 94 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  32.76 
 
 		 901 aa  48.9  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1137 aa  49.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  39.06 
 
 		 870 aa  48.9  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  30.15 
 
 		 878 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  21.81 
 
 		 818 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  34.69 
 
 		 873 aa  47.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  24.3 
 
 		 1168 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  32.12 
 
 		 874 aa  47.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  27.2 
 
 		 918 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  32.14 
 
 		 888 aa  47  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  39.22 
 
 		 724 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  30.66 
 
 		 874 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  22.31 
 
 		 798 aa  45.8  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  39.66 
 
 		 1187 aa  45.8  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  36.11 
 
 		 875 aa  45.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  39.66 
 
 		 1187 aa  45.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>