53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0827 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  100 
 
 
1137 aa  2177    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  35.72 
 
 
1180 aa  429  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  27.7 
 
 
1158 aa  289  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  27.76 
 
 
1153 aa  218  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  23.66 
 
 
968 aa  83.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  25 
 
 
1284 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  32.12 
 
 
1354 aa  64.7  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  21.94 
 
 
1280 aa  64.3  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  28.97 
 
 
1047 aa  63.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  32.18 
 
 
1126 aa  63.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  31.68 
 
 
1126 aa  62.4  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  28.1 
 
 
821 aa  56.2  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  33.33 
 
 
1467 aa  54.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  33.63 
 
 
1348 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  33 
 
 
875 aa  53.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  33.05 
 
 
1171 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.8 
 
 
1167 aa  52.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.32 
 
 
1157 aa  52  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  29.96 
 
 
1156 aa  52  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  29.96 
 
 
1156 aa  52  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  29.96 
 
 
1156 aa  52  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.63 
 
 
901 aa  51.6  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  32.69 
 
 
1185 aa  51.6  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  33.87 
 
 
906 aa  51.6  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  33.94 
 
 
1414 aa  50.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  27.72 
 
 
1351 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  28.79 
 
 
1181 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  35.8 
 
 
1156 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  29.73 
 
 
1155 aa  50.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  24.6 
 
 
1065 aa  50.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  32 
 
 
1156 aa  49.7  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.97 
 
 
1144 aa  50.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  35.19 
 
 
1156 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  36.17 
 
 
880 aa  49.3  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  31.61 
 
 
1160 aa  49.3  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.06 
 
 
729 aa  49.3  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  19.77 
 
 
922 aa  49.3  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  29.11 
 
 
1156 aa  49.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  36.08 
 
 
870 aa  49.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  28.71 
 
 
1163 aa  48.5  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  23.62 
 
 
922 aa  48.5  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  30.59 
 
 
1277 aa  48.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  29.79 
 
 
1149 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  47.83 
 
 
878 aa  46.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  27.22 
 
 
1282 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  29.84 
 
 
1153 aa  46.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  24.28 
 
 
664 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  26.86 
 
 
1186 aa  45.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  32.73 
 
 
888 aa  45.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  39.66 
 
 
873 aa  45.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  33.33 
 
 
768 aa  44.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  40.91 
 
 
1127 aa  45.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  37.31 
 
 
1157 aa  45.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>