94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2892 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  100 
 
 
1467 aa  2847    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  49.14 
 
 
1414 aa  332  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  44.4 
 
 
1354 aa  327  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  42.34 
 
 
1351 aa  261  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.68 
 
 
1284 aa  179  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  26.48 
 
 
1280 aa  164  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  31.37 
 
 
1065 aa  141  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  25.81 
 
 
974 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  25.81 
 
 
974 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.81 
 
 
974 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  25.31 
 
 
877 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  25.56 
 
 
974 aa  120  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  24.81 
 
 
974 aa  119  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  25.06 
 
 
974 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  25.56 
 
 
974 aa  116  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  25.62 
 
 
973 aa  113  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  35.4 
 
 
1282 aa  113  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  27.3 
 
 
979 aa  110  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.85 
 
 
1047 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  42.36 
 
 
729 aa  105  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.63 
 
 
812 aa  96.3  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.13 
 
 
1186 aa  95.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  29.56 
 
 
978 aa  93.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  29.56 
 
 
978 aa  93.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  35.03 
 
 
1171 aa  92  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  29.02 
 
 
830 aa  90.5  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  30.34 
 
 
1163 aa  90.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  33.77 
 
 
1210 aa  89.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  35.06 
 
 
1179 aa  88.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  36.18 
 
 
768 aa  86.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  29.72 
 
 
1185 aa  84.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  31.98 
 
 
968 aa  82  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  34.09 
 
 
1167 aa  80.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32.34 
 
 
821 aa  80.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  30.95 
 
 
1157 aa  80.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  30.68 
 
 
1157 aa  77.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  31.95 
 
 
1153 aa  76.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.89 
 
 
1167 aa  75.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  30.34 
 
 
1156 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  33.56 
 
 
1156 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  33.56 
 
 
1156 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  30.57 
 
 
1156 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  32.11 
 
 
1156 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  30.57 
 
 
1156 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  32.89 
 
 
1156 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  27.6 
 
 
1160 aa  73.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.74 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.74 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  31.54 
 
 
1348 aa  72  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  25.19 
 
 
1149 aa  71.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  27.94 
 
 
1153 aa  68.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  29.82 
 
 
1126 aa  68.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  34.15 
 
 
1155 aa  67.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  30.68 
 
 
1127 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  29.82 
 
 
1126 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  27.91 
 
 
1153 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  30.06 
 
 
1181 aa  66.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  25.33 
 
 
1144 aa  66.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  31.03 
 
 
787 aa  65.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  32.28 
 
 
1181 aa  64.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  34.75 
 
 
711 aa  63.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  33.33 
 
 
1137 aa  62.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  32.21 
 
 
1277 aa  62.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.2 
 
 
883 aa  61.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.52 
 
 
922 aa  60.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  32.33 
 
 
1155 aa  58.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  45.45 
 
 
878 aa  57.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  28.04 
 
 
1153 aa  57  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  25.52 
 
 
922 aa  57  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  28.21 
 
 
874 aa  55.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.92 
 
 
880 aa  55.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  55.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  25.9 
 
 
664 aa  55.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  42.17 
 
 
874 aa  54.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  30.31 
 
 
1201 aa  55.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  38.82 
 
 
870 aa  54.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  37.82 
 
 
1194 aa  53.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  30.89 
 
 
1158 aa  53.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  31.32 
 
 
874 aa  52.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  29.32 
 
 
188 aa  52.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  43.04 
 
 
901 aa  52  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  43.01 
 
 
917 aa  52  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  38 
 
 
723 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  26.52 
 
 
890 aa  51.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  33.07 
 
 
1152 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 
917 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.63 
 
 
873 aa  48.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  38.67 
 
 
878 aa  48.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  28.3 
 
 
1047 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  37.97 
 
 
875 aa  47  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  35.44 
 
 
875 aa  45.8  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  36.49 
 
 
880 aa  45.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>