80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3215 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2107    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  63 
 
 		 1127 aa  1122    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  95.83 
 
 		 1126 aa  1685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  38.01 
 
 		 1157 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1153 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1144 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.87 
 
 		 1171 aa  206  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  26.97 
 
 		 1163 aa  198  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1153 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1210 aa  188  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1153 aa  161  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1152 aa  156  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  31.72 
 
 		 1167 aa  154  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  42.78 
 
 		 1155 aa  152  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1151 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1152 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1155 aa  124  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1185 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1186 aa  107  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  34.78 
 
 		 1179 aa  98.2  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1157 aa  97.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1156 aa  97.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1156 aa  96.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1156 aa  95.9  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1156 aa  95.9  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1156 aa  95.5  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1156 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1149 aa  95.1  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1156 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1160 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1167 aa  91.3  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1181 aa  89.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1277 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  41.01 
 
 		 1158 aa  76.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  31.76 
 
 		 968 aa  75.5  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1181 aa  75.1  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  34.83 
 
 		 188 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1351 aa  73.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1284 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1282 aa  73.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1280 aa  72  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.68 
 
 		 729 aa  71.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  23.26 
 
 		 973 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1201 aa  68.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  21.61 
 
 		 974 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  21.61 
 
 		 974 aa  68.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  21.61 
 
 		 974 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  21.77 
 
 		 974 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.91 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  22.49 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  22 
 
 		 974 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  21.81 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  21.71 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1137 aa  60.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  30.99 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1065 aa  59.7  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1348 aa  58.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  30.71 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  30.71 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.97 
 
 		 979 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1467 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  24.15 
 
 		 664 aa  55.5  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.32 
 
 		 978 aa  54.3  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1047 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1414 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.32 
 
 		 978 aa  54.3  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  28.16 
 
 		 199 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  28.16 
 
 		 199 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  27.94 
 
 		 830 aa  51.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1158 aa  48.5  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  30.43 
 
 		 768 aa  47.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1180 aa  47.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  40 
 
 		 885 aa  47.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  24.49 
 
 		 953 aa  46.2  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1190 aa  45.8  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  38.75 
 
 		 877 aa  45.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  44.62 
 
 		 917 aa  45.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  38.75 
 
 		 877 aa  45.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  38.75 
 
 		 877 aa  45.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1153 aa  44.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>