39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1256 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  100 
 
 
1153 aa  2293    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  26.81 
 
 
1158 aa  349  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  28.01 
 
 
1137 aa  219  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  25.9 
 
 
1180 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  30.71 
 
 
1280 aa  68.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  24.71 
 
 
979 aa  67.4  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  30 
 
 
1284 aa  65.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  27.5 
 
 
973 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  27.27 
 
 
974 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  23.23 
 
 
812 aa  58.2  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  31.97 
 
 
1354 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.93 
 
 
767 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.27 
 
 
974 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.93 
 
 
767 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.19 
 
 
1047 aa  55.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  32.69 
 
 
883 aa  55.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  26.52 
 
 
1282 aa  55.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  37.14 
 
 
830 aa  53.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  28.79 
 
 
617 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.7 
 
 
1351 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.87 
 
 
1155 aa  51.6  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.1 
 
 
711 aa  51.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  22.54 
 
 
978 aa  49.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  22.54 
 
 
978 aa  49.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.22 
 
 
968 aa  48.9  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.13 
 
 
1171 aa  48.5  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.92 
 
 
922 aa  48.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.21 
 
 
922 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  29.77 
 
 
1467 aa  47  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  30.06 
 
 
712 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  32.33 
 
 
1185 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  37.04 
 
 
1201 aa  46.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.22 
 
 
787 aa  46.2  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.93 
 
 
1167 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>