27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1711 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  100 
 
 
1180 aa  2300    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  36.27 
 
 
1137 aa  442  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  27.94 
 
 
1158 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  25.68 
 
 
1153 aa  190  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.89 
 
 
1284 aa  72.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  25.32 
 
 
1282 aa  54.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  23.71 
 
 
1280 aa  53.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.99 
 
 
1351 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.1 
 
 
821 aa  52.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  36.47 
 
 
1167 aa  51.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  23.78 
 
 
968 aa  51.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  34 
 
 
711 aa  50.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  42.67 
 
 
1126 aa  48.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  37.5 
 
 
1153 aa  48.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  42.67 
 
 
1126 aa  48.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  37.08 
 
 
883 aa  48.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  30 
 
 
1163 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  37 
 
 
878 aa  47.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.61 
 
 
1065 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  33.33 
 
 
1144 aa  47.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  31.9 
 
 
1185 aa  47.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  27.46 
 
 
618 aa  46.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  40.43 
 
 
881 aa  45.8  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  25.53 
 
 
1354 aa  45.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  27.03 
 
 
830 aa  45.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  32.11 
 
 
1179 aa  45.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  22 
 
 
1047 aa  45.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>