33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4008 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  57.31 
 
 
875 aa  785    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  59.32 
 
 
883 aa  864    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  99.32 
 
 
877 aa  1676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  61.24 
 
 
885 aa  840    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.48 
 
 
877 aa  199  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  41.32 
 
 
1051 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  38.96 
 
 
874 aa  153  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  25.58 
 
 
880 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  28.08 
 
 
892 aa  86.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 
917 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  32.35 
 
 
910 aa  81.3  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  35.94 
 
 
946 aa  77.4  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  26.39 
 
 
875 aa  75.5  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.9 
 
 
880 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  33.86 
 
 
870 aa  71.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  26.62 
 
 
874 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  33.33 
 
 
878 aa  67.4  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  26.34 
 
 
874 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  33.09 
 
 
875 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  30.41 
 
 
880 aa  63.9  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  27.92 
 
 
918 aa  61.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.15 
 
 
873 aa  61.2  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.96 
 
 
634 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  28.34 
 
 
888 aa  50.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  30.19 
 
 
1080 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  23.66 
 
 
875 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25 
 
 
579 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  38.75 
 
 
1126 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  38.75 
 
 
1126 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  34.43 
 
 
1157 aa  45.8  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  28.71 
 
 
901 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>