83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5978 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  41.26 
 
 		 1153 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  89.71 
 
 		 1156 aa  1786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  81.75 
 
 		 1156 aa  1669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  100 
 
 		 1156 aa  2220    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  89.19 
 
 		 1156 aa  1838    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  89.71 
 
 		 1156 aa  1786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  89.19 
 
 		 1156 aa  1805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  97.32 
 
 		 1156 aa  1963    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  39.97 
 
 		 1155 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1186 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  27.4 
 
 		 1163 aa  274  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  28.49 
 
 		 1167 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1160 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.22 
 
 		 1179 aa  251  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  25.42 
 
 		 1171 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1153 aa  245  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1210 aa  226  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1152 aa  220  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  61.75 
 
 		 188 aa  207  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1157 aa  198  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1151 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1167 aa  160  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1153 aa  139  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1155 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1149 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1185 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1157 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  42.78 
 
 		 1152 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1144 aa  115  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1181 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  43.54 
 
 		 1181 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  36.74 
 
 		 1158 aa  105  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1201 aa  102  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1126 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1126 aa  96.3  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1348 aa  93.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1127 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1277 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1065 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  21.91 
 
 		 812 aa  80.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1284 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  20.95 
 
 		 1280 aa  75.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  30.88 
 
 		 974 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  25.53 
 
 		 968 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  35.51 
 
 		 729 aa  70.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1354 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  27.52 
 
 		 979 aa  70.1  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  27.39 
 
 		 883 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  31.5 
 
 		 767 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  31.5 
 
 		 767 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1047 aa  68.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  31.5 
 
 		 974 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1282 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 973 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1467 aa  65.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  25.5 
 
 		 978 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  25.5 
 
 		 978 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.38 
 
 		 787 aa  60.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  28.15 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1351 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  27.14 
 
 		 664 aa  60.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.67 
 
 		 922 aa  59.7  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  32.38 
 
 		 711 aa  58.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.63 
 
 		 830 aa  55.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  29.85 
 
 		 617 aa  55.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.82 
 
 		 821 aa  54.3  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  29.41 
 
 		 768 aa  54.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  38.57 
 
 		 94 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1158 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  25.7 
 
 		 877 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  27.69 
 
 		 890 aa  49.7  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1137 aa  48.9  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  21.82 
 
 		 818 aa  48.9  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  39.44 
 
 		 723 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  38.46 
 
 		 712 aa  45.8  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 917 aa  45.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  35.29 
 
 		 946 aa  44.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  46.3 
 
 		 591 aa  44.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>