102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0729 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  100 
 
 		 787 aa  1589    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  28.38 
 
 		 821 aa  274  4.0000000000000004e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  28.76 
 
 		 830 aa  254  5.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  27.68 
 
 		 812 aa  234  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  26.76 
 
 		 974 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  28.29 
 
 		 974 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.65 
 
 		 974 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.96 
 
 		 974 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.96 
 
 		 974 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.65 
 
 		 974 aa  124  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.72 
 
 		 974 aa  124  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  26.96 
 
 		 877 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  28.85 
 
 		 973 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  29.62 
 
 		 978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  29.62 
 
 		 978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  32.18 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  32.18 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  28.86 
 
 		 979 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1065 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1280 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  37.72 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  37.72 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  46.51 
 
 		 664 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1414 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1354 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1351 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.13 
 
 		 1171 aa  75.1  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1284 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  26.64 
 
 		 1167 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1282 aa  72  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1160 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1185 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.94 
 
 		 711 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.1 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  24.55 
 
 		 1179 aa  67.8  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  31.65 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  37.21 
 
 		 883 aa  65.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  40.62 
 
 		 818 aa  65.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1155 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  32.62 
 
 		 968 aa  65.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1126 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1144 aa  65.1  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  35.96 
 
 		 617 aa  65.1  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1153 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1186 aa  64.7  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1163 aa  64.7  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1348 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1047 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  39.24 
 
 		 817 aa  63.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1210 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1194 aa  62.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1156 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  38.36 
 
 		 94 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1156 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1156 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1181 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1156 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1277 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  35.58 
 
 		 890 aa  60.1  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  34.21 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1181 aa  58.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1155 aa  58.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  27.81 
 
 		 729 aa  58.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1149 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.8 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1153 aa  57.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1157 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1158 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  31.09 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1201 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1127 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  35.29 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1157 aa  53.9  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1152 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  29.81 
 
 		 829 aa  52.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1152 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1467 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1167 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  26.38 
 
 		 918 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 917 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  23.31 
 
 		 917 aa  50.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1151 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1158 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  30.77 
 
 		 798 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  34.07 
 
 		 873 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  32.97 
 
 		 875 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  31.52 
 
 		 870 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  33.78 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1153 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  24.71 
 
 		 955 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.28 
 
 		 789 aa  46.2  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  31.13 
 
 		 1047 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1153 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  27.61 
 
 		 188 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  32.81 
 
 		 877 aa  44.3  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>