64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5391 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  100 
 
 		 875 aa  1709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  54.22 
 
 		 873 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  36.09 
 
 		 870 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.42 
 
 		 880 aa  185  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.01 
 
 		 880 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  28.95 
 
 		 878 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  28.77 
 
 		 874 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  29.57 
 
 		 874 aa  144  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  37.84 
 
 		 880 aa  109  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  38.82 
 
 		 875 aa  105  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  40.4 
 
 		 888 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.6 
 
 		 881 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  25.11 
 
 		 875 aa  94  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  23.16 
 
 		 918 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  28.37 
 
 		 878 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  42.34 
 
 		 877 aa  73.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  33.09 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  33.09 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  33.09 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  32.58 
 
 		 885 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  32.59 
 
 		 883 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  31.5 
 
 		 875 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  26.79 
 
 		 892 aa  60.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.27 
 
 		 910 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  26.06 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  26.06 
 
 		 978 aa  59.3  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  34.59 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  30.56 
 
 		 922 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  29.17 
 
 		 922 aa  55.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  27.72 
 
 		 974 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1282 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1284 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  35.29 
 
 		 883 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  27.85 
 
 		 946 aa  53.5  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  31.82 
 
 		 917 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  41.54 
 
 		 979 aa  52  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  34.88 
 
 		 901 aa  52.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  25.21 
 
 		 974 aa  51.6  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  22.33 
 
 		 664 aa  51.2  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  25.64 
 
 		 974 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1210 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  26.77 
 
 		 974 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  24.79 
 
 		 974 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  25.64 
 
 		 974 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.56 
 
 		 974 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1194 aa  48.9  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 767 aa  48.5  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 767 aa  48.5  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  24.88 
 
 		 830 aa  48.5  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.31 
 
 		 729 aa  48.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  29.81 
 
 		 1047 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1354 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  32.97 
 
 		 787 aa  47.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  34.04 
 
 		 890 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  33.75 
 
 		 1167 aa  47.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 812 aa  47.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1155 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1351 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1185 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.47 
 
 		 935 aa  46.2  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  31.82 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  29.89 
 
 		 968 aa  45.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1065 aa  44.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  26.77 
 
 		 973 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>