59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0907 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  54.17 
 
 		 875 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1695    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  35.76 
 
 		 870 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.23 
 
 		 880 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  27.72 
 
 		 878 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  28.94 
 
 		 880 aa  178  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  28.03 
 
 		 881 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  27.5 
 
 		 878 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  27.71 
 
 		 874 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  26.96 
 
 		 874 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  26.59 
 
 		 875 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  39.58 
 
 		 875 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  38.41 
 
 		 888 aa  95.1  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  43.52 
 
 		 877 aa  72.8  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 885 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  34.81 
 
 		 918 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  32.28 
 
 		 883 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  30.37 
 
 		 978 aa  58.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  30.37 
 
 		 978 aa  58.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  31.51 
 
 		 922 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  27.26 
 
 		 910 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 917 aa  57  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  37.5 
 
 		 883 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  30.88 
 
 		 922 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  26.56 
 
 		 946 aa  55.1  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  24.4 
 
 		 979 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1284 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  37.23 
 
 		 875 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  36.47 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  29.15 
 
 		 877 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  29.15 
 
 		 877 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1282 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.02 
 
 		 812 aa  51.6  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  40.43 
 
 		 821 aa  51.2  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  33.62 
 
 		 877 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.33 
 
 		 729 aa  50.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1210 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  34.94 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.18 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1351 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  34.07 
 
 		 787 aa  48.9  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1155 aa  48.5  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  32.14 
 
 		 1047 aa  48.5  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  29.47 
 
 		 1171 aa  48.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  32.1 
 
 		 1167 aa  48.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1354 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  25.24 
 
 		 987 aa  47.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1051 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1160 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  29.84 
 
 		 1163 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 830 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1065 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1137 aa  45.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  25.25 
 
 		 664 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1201 aa  45.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.67 
 
 		 723 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1414 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>