53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3142 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 875 aa  1697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  42.08 
 
 		 881 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  36.55 
 
 		 880 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  29.97 
 
 		 880 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  29.09 
 
 		 875 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  30.12 
 
 		 878 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  29.42 
 
 		 874 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  29.28 
 
 		 874 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  40.69 
 
 		 888 aa  135  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  28.36 
 
 		 878 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  27.76 
 
 		 880 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  38.32 
 
 		 875 aa  104  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  39.19 
 
 		 873 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  36 
 
 		 892 aa  97.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.12 
 
 		 917 aa  94.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  41.3 
 
 		 870 aa  93.2  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  27.14 
 
 		 901 aa  92  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  35.79 
 
 		 874 aa  63.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  32.21 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  39.36 
 
 		 877 aa  59.7  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  38.24 
 
 		 922 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  36.76 
 
 		 922 aa  55.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1065 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  30.3 
 
 		 910 aa  53.9  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  33.72 
 
 		 968 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.71 
 
 		 955 aa  52  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  33.04 
 
 		 885 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.87 
 
 		 729 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  34.31 
 
 		 812 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  35.29 
 
 		 883 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1155 aa  49.7  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  44 
 
 		 712 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  23.78 
 
 		 978 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  23.78 
 
 		 978 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1185 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 784 aa  47.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  33.62 
 
 		 1171 aa  47.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  35.48 
 
 		 644 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  30.22 
 
 		 723 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  30.43 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1181 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1351 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.86 
 
 		 634 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1160 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  24.18 
 
 		 818 aa  45.8  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1284 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.97 
 
 		 1057 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  29.07 
 
 		 974 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  36.14 
 
 		 648 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  31.48 
 
 		 1208 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1282 aa  44.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  34.85 
 
 		 812 aa  44.3  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  29.07 
 
 		 974 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>