110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0069 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  100 
 
 
1284 aa  2579    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  39.36 
 
 
1280 aa  927    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  23.47 
 
 
1282 aa  270  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  31.49 
 
 
1065 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.46 
 
 
1354 aa  171  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  29.57 
 
 
1351 aa  164  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  28.91 
 
 
1467 aa  162  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  22.98 
 
 
1163 aa  144  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.01 
 
 
1414 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.93 
 
 
1047 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.05 
 
 
974 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  28.07 
 
 
974 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.68 
 
 
974 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.18 
 
 
974 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  26.93 
 
 
974 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  27.71 
 
 
973 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.39 
 
 
974 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  26.43 
 
 
877 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.28 
 
 
974 aa  125  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  28.97 
 
 
767 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  28.97 
 
 
767 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  23.68 
 
 
1185 aa  116  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  29.8 
 
 
830 aa  116  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.03 
 
 
812 aa  115  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  25.16 
 
 
1171 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  24.73 
 
 
979 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  98.2  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  98.2  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  25.56 
 
 
978 aa  97.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  25.56 
 
 
978 aa  97.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.77 
 
 
729 aa  94.7  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  28.63 
 
 
968 aa  92.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  35.44 
 
 
768 aa  89.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  22.27 
 
 
1160 aa  89.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  33.56 
 
 
1157 aa  86.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  26.21 
 
 
1153 aa  85.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  27.66 
 
 
1149 aa  85.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  34.64 
 
 
821 aa  85.1  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  23.09 
 
 
1210 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.5 
 
 
1144 aa  82.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  23.48 
 
 
1186 aa  80.9  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  28.99 
 
 
1201 aa  80.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  24.76 
 
 
1156 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  22.62 
 
 
1126 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  22.55 
 
 
1167 aa  79.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  22.82 
 
 
1126 aa  75.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28 
 
 
1179 aa  75.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  23.73 
 
 
1156 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  23.73 
 
 
1156 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.65 
 
 
787 aa  73.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  25.18 
 
 
1157 aa  73.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  23.6 
 
 
1156 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  28.67 
 
 
1277 aa  73.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  22.33 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  22.33 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  29.89 
 
 
1180 aa  72.4  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  26.11 
 
 
1137 aa  72.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  22.33 
 
 
1156 aa  72  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  27.61 
 
 
1167 aa  71.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  25.64 
 
 
1153 aa  70.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  44.16 
 
 
94 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  24.24 
 
 
1153 aa  68.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 
917 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  29.49 
 
 
1181 aa  67.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  29.03 
 
 
1348 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  24.01 
 
 
883 aa  64.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.74 
 
 
922 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  28.66 
 
 
1158 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  26.7 
 
 
1155 aa  63.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.47 
 
 
922 aa  63.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  25.41 
 
 
1127 aa  63.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  25.25 
 
 
1153 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  22.88 
 
 
1158 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  36.26 
 
 
870 aa  60.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  27.17 
 
 
890 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 
711 aa  59.3  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  32.12 
 
 
1194 aa  59.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  27.08 
 
 
1155 aa  57.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 
1047 aa  56.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  35.44 
 
 
874 aa  56.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  35.44 
 
 
874 aa  55.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  43.84 
 
 
758 aa  55.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  43.84 
 
 
758 aa  55.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  29.92 
 
 
878 aa  55.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  24.1 
 
 
188 aa  55.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.61 
 
 
664 aa  55.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  31.58 
 
 
873 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  33.33 
 
 
875 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  27.16 
 
 
918 aa  53.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.44 
 
 
880 aa  51.6  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  37.66 
 
 
878 aa  51.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  32.1 
 
 
617 aa  51.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  38.03 
 
 
946 aa  50.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  33.56 
 
 
955 aa  50.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  22.26 
 
 
1181 aa  50.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  29.45 
 
 
723 aa  49.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  31.53 
 
 
901 aa  49.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  32 
 
 
874 aa  49.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  25.89 
 
 
880 aa  48.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  32.89 
 
 
885 aa  47.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>