109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2412 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  100 
 
 
883 aa  1768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  39.86 
 
 
664 aa  213  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.92 
 
 
922 aa  177  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  31.1 
 
 
922 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  35.15 
 
 
711 aa  90.1  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  21.37 
 
 
821 aa  89  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  26.78 
 
 
974 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  31.21 
 
 
917 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.96 
 
 
729 aa  80.1  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  30.47 
 
 
617 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  32.23 
 
 
974 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.14 
 
 
974 aa  77.8  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  28.98 
 
 
1186 aa  77.4  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.67 
 
 
979 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  34.64 
 
 
1351 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  28.89 
 
 
973 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  26.77 
 
 
974 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  31.75 
 
 
767 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  31.75 
 
 
767 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  32.23 
 
 
974 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  31.75 
 
 
974 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  35.56 
 
 
1156 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  32.18 
 
 
974 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  26.14 
 
 
877 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  34.62 
 
 
1280 aa  71.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  35.71 
 
 
1153 aa  71.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  34.81 
 
 
1156 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  28.63 
 
 
1157 aa  70.5  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  27.72 
 
 
1156 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  34.81 
 
 
1156 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  34.81 
 
 
1156 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  34.81 
 
 
1156 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  43.01 
 
 
978 aa  70.1  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  43.01 
 
 
978 aa  70.1  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  34.81 
 
 
1156 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  42.11 
 
 
1065 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  45.33 
 
 
94 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  34.15 
 
 
1171 aa  68.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  24.17 
 
 
1282 aa  68.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 
1047 aa  67.8  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.85 
 
 
724 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  37.21 
 
 
787 aa  65.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.01 
 
 
1284 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  36.36 
 
 
758 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  36.36 
 
 
758 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  34.31 
 
 
188 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  35.65 
 
 
1160 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  39.77 
 
 
1181 aa  62  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  33.33 
 
 
812 aa  62  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.7 
 
 
723 aa  61.6  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  28.32 
 
 
830 aa  61.2  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  30.19 
 
 
1158 aa  61.6  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  39.18 
 
 
818 aa  60.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  33.04 
 
 
1167 aa  60.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  31.15 
 
 
1167 aa  60.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  41.94 
 
 
1155 aa  60.1  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  29.94 
 
 
768 aa  60.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  31.69 
 
 
199 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  31.69 
 
 
199 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  33.08 
 
 
1348 aa  58.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  33.93 
 
 
1149 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  37.8 
 
 
1185 aa  58.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  43.75 
 
 
1210 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  22.5 
 
 
1047 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  25.49 
 
 
1354 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  37.5 
 
 
873 aa  57  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  35.71 
 
 
1153 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  32.56 
 
 
1155 aa  55.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  32.69 
 
 
1153 aa  55.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 
870 aa  54.7  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  33.33 
 
 
1163 aa  54.7  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  28.09 
 
 
880 aa  54.3  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  29.41 
 
 
712 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  38.24 
 
 
881 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  34.57 
 
 
1179 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  35.29 
 
 
875 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  38.89 
 
 
877 aa  52.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  42.47 
 
 
917 aa  52.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  28.57 
 
 
968 aa  52.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  30 
 
 
1277 aa  52.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  29.68 
 
 
918 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  35.87 
 
 
878 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  29.09 
 
 
1153 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  35.29 
 
 
875 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.33 
 
 
875 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  30.4 
 
 
1467 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  31.01 
 
 
910 aa  49.3  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  39.06 
 
 
1127 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  32.23 
 
 
890 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  31.21 
 
 
1414 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  29.7 
 
 
955 aa  48.5  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  24.64 
 
 
618 aa  48.5  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3265  DNA repair ATPase-like protein  23.27 
 
 
757 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  23.57 
 
 
798 aa  48.9  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  29.57 
 
 
1144 aa  48.5  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  37.08 
 
 
1180 aa  48.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  29.06 
 
 
978 aa  47.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  25.66 
 
 
1194 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  25 
 
 
840 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  34.07 
 
 
1080 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>