101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1930 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  69.77 
 
 
979 aa  1404    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  100 
 
 
978 aa  1985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  100 
 
 
978 aa  1985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  25.43 
 
 
973 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  23.9 
 
 
974 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  24.1 
 
 
974 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  24.4 
 
 
974 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.47 
 
 
974 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  23.08 
 
 
877 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  25.98 
 
 
974 aa  177  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.18 
 
 
974 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  29.49 
 
 
974 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  36.5 
 
 
199 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  36.5 
 
 
199 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  29.17 
 
 
1280 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.82 
 
 
1065 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  29.62 
 
 
787 aa  115  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  28.83 
 
 
1282 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32 
 
 
821 aa  108  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  31.17 
 
 
830 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  25.49 
 
 
1354 aa  106  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  28.16 
 
 
1284 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.35 
 
 
1351 aa  94  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  30.46 
 
 
767 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  30.46 
 
 
767 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.75 
 
 
812 aa  85.9  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  27.6 
 
 
729 aa  79.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  24.13 
 
 
1467 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  24.55 
 
 
1414 aa  75.1  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  43.01 
 
 
883 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  29.7 
 
 
768 aa  70.1  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  26.63 
 
 
968 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  26.54 
 
 
1185 aa  68.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  23.89 
 
 
1160 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  35.87 
 
 
617 aa  65.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  24.55 
 
 
1163 aa  65.1  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  22.26 
 
 
1167 aa  64.3  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  24.26 
 
 
1157 aa  64.3  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  23.28 
 
 
1149 aa  64.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  32.17 
 
 
1153 aa  62.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  25.5 
 
 
1156 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  34.02 
 
 
922 aa  62.4  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  22.73 
 
 
1186 aa  61.6  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  24.83 
 
 
1156 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  34.02 
 
 
922 aa  61.6  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  27.44 
 
 
1201 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  24.47 
 
 
1158 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  34.41 
 
 
664 aa  59.3  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  35 
 
 
711 aa  58.9  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  30.37 
 
 
873 aa  58.2  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  26.06 
 
 
875 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  27.23 
 
 
1155 aa  57  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  26.55 
 
 
1277 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  22.16 
 
 
1167 aa  56.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  24.03 
 
 
1144 aa  55.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  29.46 
 
 
917 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  26.96 
 
 
1348 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  22.26 
 
 
719 aa  54.7  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  22.81 
 
 
1127 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  23.32 
 
 
1126 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  22.94 
 
 
1157 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  35.56 
 
 
1181 aa  52.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  23.28 
 
 
1126 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  30.36 
 
 
890 aa  52  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  24.44 
 
 
817 aa  52  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  24.38 
 
 
901 aa  51.6  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  29.37 
 
 
1171 aa  51.2  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  25.86 
 
 
712 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  25.42 
 
 
1152 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  23.81 
 
 
1155 aa  50.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  28.78 
 
 
1153 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  25.24 
 
 
1158 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  25.34 
 
 
1181 aa  50.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  22.04 
 
 
880 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  32.43 
 
 
1210 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  22.54 
 
 
1153 aa  49.7  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  25.42 
 
 
877 aa  49.3  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.02 
 
 
724 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  23.33 
 
 
723 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  34.07 
 
 
1151 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  38.03 
 
 
1153 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 
1057 aa  47  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  37.88 
 
 
619 aa  47  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  35.14 
 
 
818 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.6 
 
 
891 aa  47  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  33.33 
 
 
874 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  20.59 
 
 
1179 aa  46.2  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  30.77 
 
 
870 aa  45.8  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  32.93 
 
 
880 aa  45.8  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  40.38 
 
 
1152 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  34.85 
 
 
875 aa  45.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  25.42 
 
 
552 aa  45.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  21.31 
 
 
804 aa  44.7  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  29.47 
 
 
910 aa  44.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>