58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5217 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  47.15 
 
 		 874 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 878 aa  1741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  47.14 
 
 		 874 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  35.74 
 
 		 878 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  34.73 
 
 		 880 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  31.44 
 
 		 875 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.46 
 
 		 880 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  29.91 
 
 		 875 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  27.93 
 
 		 873 aa  153  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  27.4 
 
 		 917 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  40.94 
 
 		 880 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.69 
 
 		 881 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  23.78 
 
 		 901 aa  95.5  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  40.17 
 
 		 888 aa  87.8  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  40.16 
 
 		 870 aa  84.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  37.61 
 
 		 875 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  36.18 
 
 		 877 aa  74.3  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  31.13 
 
 		 892 aa  72  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.38 
 
 		 918 aa  67.8  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  26.08 
 
 		 910 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  34.81 
 
 		 1354 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1051 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  26.01 
 
 		 946 aa  60.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  31.98 
 
 		 885 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1284 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  27.4 
 
 		 617 aa  55.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  29.82 
 
 		 874 aa  55.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  39.39 
 
 		 729 aa  54.3  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  25.98 
 
 		 917 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.72 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  26.03 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  35.87 
 
 		 883 aa  52  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1181 aa  51.6  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1065 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.56 
 
 		 912 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  37.74 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  28.51 
 
 		 883 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1160 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  30.19 
 
 		 1179 aa  48.5  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1282 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  46.75 
 
 		 1467 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  35.71 
 
 		 812 aa  47.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1155 aa  47.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  36.92 
 
 		 979 aa  47  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1280 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  44.23 
 
 		 1174 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  30.88 
 
 		 1171 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1190 aa  45.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.11 
 
 		 582 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  42.22 
 
 		 1186 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 968 aa  45.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  28.49 
 
 		 711 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  34.29 
 
 		 821 aa  45.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.91 
 
 		 1190 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  44.9 
 
 		 1184 aa  44.7  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>