92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1098 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 917 aa  1813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 		 1047 aa  137  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.85 
 
 		 883 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  26.94 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1284 aa  68.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  22.94 
 
 		 812 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.17 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.92 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.14 
 
 		 789 aa  60.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.11 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 768 aa  60.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1280 aa  59.3  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.34 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1194 aa  58.9  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1153 aa  58.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  51.92 
 
 		 1171 aa  58.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1155 aa  58.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.52 
 
 		 922 aa  58.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.25 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  28.24 
 
 		 979 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  51.92 
 
 		 1210 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1065 aa  57.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1185 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1348 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  35.92 
 
 		 712 aa  56.2  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1149 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30 
 
 		 1351 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  28.36 
 
 		 918 aa  55.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 798 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  28.46 
 
 		 974 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  29.46 
 
 		 978 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  26.39 
 
 		 974 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  29.46 
 
 		 978 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  27.64 
 
 		 974 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1047 aa  54.7  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.64 
 
 		 767 aa  54.7  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.64 
 
 		 767 aa  54.7  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.64 
 
 		 974 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.64 
 
 		 974 aa  54.3  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  25.98 
 
 		 878 aa  54.3  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  25.54 
 
 		 874 aa  54.3  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1167 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.64 
 
 		 974 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  25.71 
 
 		 874 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.64 
 
 		 974 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  51.92 
 
 		 1167 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  31.82 
 
 		 875 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  33.94 
 
 		 840 aa  52.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.08 
 
 		 830 aa  52.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  37.68 
 
 		 1163 aa  52  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1181 aa  51.6  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  32.08 
 
 		 890 aa  51.6  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1160 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1144 aa  51.2  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1157 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  29.36 
 
 		 787 aa  51.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1156 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1153 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  30.81 
 
 		 1291 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1158 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  24.77 
 
 		 821 aa  49.7  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.88 
 
 		 369 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1157 aa  49.7  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  26.21 
 
 		 617 aa  49.3  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  24.82 
 
 		 1179 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  24.87 
 
 		 880 aa  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  35.53 
 
 		 877 aa  48.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1127 aa  47.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.25 
 
 		 875 aa  47.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  31.36 
 
 		 888 aa  47.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  38.18 
 
 		 902 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  30.77 
 
 		 829 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1156 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1156 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1156 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1467 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1282 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  32.14 
 
 		 870 aa  46.2  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1126 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  24.53 
 
 		 973 aa  45.8  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1354 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1156 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1201 aa  45.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1156 aa  44.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1156 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  37.5 
 
 		 924 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 		 1057 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 852 aa  44.7  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 852 aa  44.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1152 aa  44.3  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  43.08 
 
 		 1126 aa  44.3  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>