92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1092 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  47.98 
 
 		 1171 aa  978    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 1210 aa  2439    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  41.06 
 
 		 1167 aa  732    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  36.22 
 
 		 1163 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1160 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1186 aa  292  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1181 aa  278  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1185 aa  261  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1158 aa  240  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1152 aa  238  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1153 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1152 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1151 aa  229  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1155 aa  224  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1153 aa  224  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1156 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1156 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1156 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1153 aa  198  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1149 aa  189  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1144 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1167 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  24.76 
 
 		 1179 aa  138  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1157 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1157 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1155 aa  131  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1127 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  39.16 
 
 		 1181 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1126 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1156 aa  125  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1156 aa  125  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1126 aa  124  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1156 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1156 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1201 aa  98.6  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  35.23 
 
 		 188 aa  92  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1348 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1351 aa  90.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1277 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1065 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1284 aa  81.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1354 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  21.61 
 
 		 974 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  21.9 
 
 		 974 aa  78.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  22.09 
 
 		 974 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  22.38 
 
 		 974 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.68 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1280 aa  74.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  29.23 
 
 		 830 aa  74.3  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  37.06 
 
 		 1467 aa  73.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.06 
 
 		 968 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  21.8 
 
 		 974 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  21.75 
 
 		 974 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1282 aa  73.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  21.33 
 
 		 877 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  20.64 
 
 		 974 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  26.92 
 
 		 812 aa  70.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  21.74 
 
 		 973 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1414 aa  64.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.33 
 
 		 664 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  34.58 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  25.37 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.72 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  40 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  24.78 
 
 		 922 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  35.42 
 
 		 768 aa  57  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  43.75 
 
 		 883 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  51.92 
 
 		 917 aa  57  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.35 
 
 		 724 aa  57.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  24.02 
 
 		 199 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  24.02 
 
 		 199 aa  55.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  28.12 
 
 		 767 aa  55.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  28.12 
 
 		 767 aa  55.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  28.18 
 
 		 979 aa  54.3  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  34.34 
 
 		 712 aa  53.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1194 aa  51.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  32.94 
 
 		 873 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  30 
 
 		 821 aa  49.7  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  32.43 
 
 		 978 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  32.43 
 
 		 978 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  32.95 
 
 		 875 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  37.14 
 
 		 870 aa  47.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 1805 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 1932 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  40.74 
 
 		 1023 aa  47.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  28.24 
 
 		 874 aa  47  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  28.08 
 
 		 881 aa  45.8  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  30 
 
 		 946 aa  45.8  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  38.89 
 
 		 962 aa  45.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  37.04 
 
 		 986 aa  45.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  22.5 
 
 		 1219 aa  44.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>