91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0999 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  100 
 
 
1167 aa  2235    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  34.62 
 
 
1160 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  29.77 
 
 
1171 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  31.16 
 
 
1167 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  29.07 
 
 
1186 aa  313  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  29.53 
 
 
1163 aa  313  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  28.33 
 
 
1210 aa  310  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  39.08 
 
 
1149 aa  304  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  29.43 
 
 
1153 aa  248  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  26.4 
 
 
1153 aa  247  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  27.88 
 
 
1179 aa  244  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  28.99 
 
 
1153 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.68 
 
 
1157 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  29.19 
 
 
1181 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  26.22 
 
 
1185 aa  225  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  43.81 
 
 
1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  43.81 
 
 
1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  43.81 
 
 
1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  43.81 
 
 
1156 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  44.94 
 
 
1156 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  37.06 
 
 
1156 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  36.17 
 
 
1156 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  41.28 
 
 
1151 aa  129  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.21 
 
 
1144 aa  127  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  35.68 
 
 
1152 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  37.08 
 
 
1155 aa  122  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.3 
 
 
1348 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  38.89 
 
 
1201 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  34.7 
 
 
1157 aa  112  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  38.71 
 
 
1181 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  38.51 
 
 
1152 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  41.04 
 
 
188 aa  111  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  35.69 
 
 
1155 aa  110  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  44.52 
 
 
1158 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  20.54 
 
 
1282 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.33 
 
 
1354 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  22.73 
 
 
1280 aa  98.2  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  29.27 
 
 
1126 aa  97.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  28.54 
 
 
1126 aa  93.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  30.92 
 
 
1277 aa  88.6  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  36.41 
 
 
1127 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  21.89 
 
 
1284 aa  79.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.39 
 
 
974 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  24.9 
 
 
974 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  28.97 
 
 
1351 aa  75.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  27.31 
 
 
974 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.5 
 
 
974 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  26.01 
 
 
830 aa  73.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.95 
 
 
664 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  25.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  23.71 
 
 
974 aa  72  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  24.1 
 
 
877 aa  72  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  34.55 
 
 
812 aa  71.6  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.47 
 
 
974 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  32.14 
 
 
1467 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  24.4 
 
 
1047 aa  68.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  31.85 
 
 
973 aa  68.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  31.85 
 
 
767 aa  67.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  24.66 
 
 
1065 aa  67.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  31.85 
 
 
767 aa  67.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  24.47 
 
 
821 aa  67  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.43 
 
 
922 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  30.34 
 
 
1414 aa  66.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  23.46 
 
 
922 aa  65.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  22.8 
 
 
978 aa  64.7  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  22.8 
 
 
978 aa  64.7  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  30.77 
 
 
729 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  31.15 
 
 
883 aa  59.7  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.68 
 
 
723 aa  58.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.89 
 
 
979 aa  57.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  40.54 
 
 
711 aa  57.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  28.29 
 
 
768 aa  57  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  37.93 
 
 
712 aa  55.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.52 
 
 
724 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.83 
 
 
917 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  21.16 
 
 
787 aa  53.5  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  34.96 
 
 
648 aa  52  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  34.96 
 
 
644 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  31.25 
 
 
1194 aa  51.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.83 
 
 
968 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  30.52 
 
 
917 aa  50.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  24.55 
 
 
818 aa  49.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  36.23 
 
 
94 aa  48.1  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  29.1 
 
 
901 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  46.15 
 
 
758 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  46.15 
 
 
758 aa  46.2  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  28.4 
 
 
1158 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  31.93 
 
 
1153 aa  45.8  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  26.36 
 
 
890 aa  45.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.4 
 
 
989 aa  45.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  27.92 
 
 
1047 aa  44.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>