113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1246 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 1354 aa  2707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1351 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  43.95 
 
 		 1467 aa  321  7e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1280 aa  299  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  45.59 
 
 		 1414 aa  235  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1284 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1065 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.27 
 
 		 974 aa  129  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.27 
 
 		 974 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  26.96 
 
 		 974 aa  127  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  24.94 
 
 		 974 aa  128  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  26.67 
 
 		 974 aa  125  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  25.57 
 
 		 877 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.06 
 
 		 974 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  24.68 
 
 		 973 aa  123  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.08 
 
 		 974 aa  121  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1047 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  24.83 
 
 		 979 aa  115  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  25.49 
 
 		 978 aa  109  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  25.49 
 
 		 978 aa  109  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  27.98 
 
 		 1163 aa  108  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1167 aa  102  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  29.06 
 
 		 199 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  29.06 
 
 		 199 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.94 
 
 		 830 aa  99.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1282 aa  96.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  32.8 
 
 		 729 aa  89.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.17 
 
 		 968 aa  89  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  25.4 
 
 		 1167 aa  87  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  34.48 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  31.22 
 
 		 812 aa  85.1  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1185 aa  82.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.26 
 
 		 1179 aa  80.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  21.08 
 
 		 787 aa  79.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  29.49 
 
 		 821 aa  77.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1210 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1149 aa  77.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  26.61 
 
 		 1171 aa  75.5  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1155 aa  74.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  29 
 
 		 1153 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1126 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1157 aa  73.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1348 aa  72  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1160 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1153 aa  70.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1156 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1156 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1156 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1156 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1156 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1156 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  27.08 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  27.08 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1156 aa  67  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1153 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  29.43 
 
 		 874 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1137 aa  64.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1201 aa  64.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  34.81 
 
 		 878 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  29.03 
 
 		 874 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1151 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1152 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  22.78 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1186 aa  58.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1157 aa  58.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1158 aa  58.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1277 aa  58.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  34.06 
 
 		 1194 aa  57.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1153 aa  57.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  25.49 
 
 		 883 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  21.74 
 
 		 664 aa  57.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.62 
 
 		 723 aa  57  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1158 aa  56.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  31.3 
 
 		 890 aa  56.2  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  30 
 
 		 1126 aa  55.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  22.22 
 
 		 922 aa  55.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1127 aa  55.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1181 aa  55.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  27.11 
 
 		 188 aa  52.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1181 aa  52.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  22.94 
 
 		 1181 aa  52  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  31.17 
 
 		 880 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  29.03 
 
 		 917 aa  51.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1152 aa  50.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  41.67 
 
 		 878 aa  50.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  41.25 
 
 		 874 aa  49.3  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  26.67 
 
 		 918 aa  49.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  42.25 
 
 		 875 aa  48.9  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  29 
 
 		 910 aa  48.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  31.78 
 
 		 873 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  34.09 
 
 		 901 aa  48.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  21.88 
 
 		 978 aa  47.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  36.07 
 
 		 1194 aa  47  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1155 aa  47.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 		 880 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  38.36 
 
 		 875 aa  47  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  25.21 
 
 		 917 aa  46.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  25.97 
 
 		 1199 aa  46.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1191 aa  45.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>