59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1036 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  100 
 
 
890 aa  1759    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  34.43 
 
 
798 aa  185  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  34.21 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  34.21 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  34.21 
 
 
974 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  32.28 
 
 
1185 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  31.58 
 
 
973 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  36.61 
 
 
830 aa  64.3  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  27.17 
 
 
1284 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.97 
 
 
1354 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24.25 
 
 
858 aa  61.6  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  31.37 
 
 
1282 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  35.58 
 
 
787 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  35.51 
 
 
979 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.29 
 
 
864 aa  58.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  32.08 
 
 
821 aa  57.4  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  28.79 
 
 
1065 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  28.46 
 
 
1156 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  30.49 
 
 
617 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  27.69 
 
 
1156 aa  53.5  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  28.46 
 
 
1156 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  28.46 
 
 
1156 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  26.32 
 
 
1186 aa  52.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  28.46 
 
 
1156 aa  52.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  30.36 
 
 
978 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  30.36 
 
 
978 aa  52.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  33.73 
 
 
664 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  32.08 
 
 
917 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  36.78 
 
 
891 aa  51.6  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  27.91 
 
 
1149 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  25.96 
 
 
883 aa  51.2  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  30.17 
 
 
1153 aa  51.2  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  29.36 
 
 
922 aa  51.2  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.5 
 
 
804 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  27.69 
 
 
1156 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  27.69 
 
 
1156 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  27.46 
 
 
1351 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  36.96 
 
 
1194 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  29.57 
 
 
829 aa  48.9  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  24.43 
 
 
918 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  25.42 
 
 
1348 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  34.04 
 
 
875 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.62 
 
 
724 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.09 
 
 
711 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  27.97 
 
 
1280 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  30.48 
 
 
910 aa  47  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  23.12 
 
 
1167 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  27.1 
 
 
1047 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  25.78 
 
 
1167 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  24.67 
 
 
1160 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  20.81 
 
 
1188 aa  45.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  27.78 
 
 
1179 aa  44.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  25 
 
 
1467 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>