105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3624 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  100 
 
 
1351 aa  2675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  31.32 
 
 
1354 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  25.09 
 
 
1284 aa  299  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  23.95 
 
 
1280 aa  292  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  41.6 
 
 
1414 aa  277  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  39.92 
 
 
1467 aa  265  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.75 
 
 
1065 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  28.2 
 
 
974 aa  162  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  27.94 
 
 
974 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  27.68 
 
 
974 aa  160  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  27.42 
 
 
974 aa  158  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  27.68 
 
 
974 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  27.79 
 
 
974 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  27.94 
 
 
973 aa  153  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  27.71 
 
 
877 aa  154  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  26.89 
 
 
974 aa  151  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  34.92 
 
 
1282 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  115  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  115  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  33.19 
 
 
1163 aa  110  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  28.99 
 
 
1186 aa  104  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  38.51 
 
 
729 aa  104  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  31.75 
 
 
1149 aa  103  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.93 
 
 
1047 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  30.26 
 
 
979 aa  99.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  28.24 
 
 
830 aa  97.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  42.07 
 
 
768 aa  97.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  26.71 
 
 
978 aa  96.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  26.71 
 
 
978 aa  96.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  32.55 
 
 
787 aa  95.9  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  29.52 
 
 
1171 aa  91.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  30.28 
 
 
1210 aa  90.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  32.51 
 
 
1185 aa  90.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.18 
 
 
1155 aa  87.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  24.71 
 
 
812 aa  87  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  28.51 
 
 
1201 aa  85.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  23.33 
 
 
1167 aa  85.1  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  27.7 
 
 
1157 aa  84.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  36.36 
 
 
1277 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  27.69 
 
 
968 aa  80.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  33.09 
 
 
1179 aa  77.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  28.57 
 
 
1160 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  30.43 
 
 
1157 aa  76.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  28.7 
 
 
1126 aa  75.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  34.64 
 
 
883 aa  75.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  30.35 
 
 
1153 aa  75.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  28.25 
 
 
1126 aa  74.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  23.65 
 
 
821 aa  73.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  33.09 
 
 
1348 aa  72.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  29.39 
 
 
1156 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  30.11 
 
 
1156 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  28.42 
 
 
1156 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  29.75 
 
 
1156 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  29.75 
 
 
1156 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  23.45 
 
 
922 aa  67.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  28.78 
 
 
1156 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  29.72 
 
 
1181 aa  67.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  28.97 
 
 
1167 aa  67.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  24.32 
 
 
922 aa  67  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  31.15 
 
 
767 aa  66.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  31.15 
 
 
767 aa  66.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  33.85 
 
 
880 aa  64.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  28.04 
 
 
1144 aa  62  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  31.69 
 
 
1181 aa  61.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  28.06 
 
 
1156 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  26.12 
 
 
1151 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  28.78 
 
 
1047 aa  58.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  41.43 
 
 
874 aa  58.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  36.44 
 
 
1153 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  27 
 
 
1158 aa  58.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  41.18 
 
 
874 aa  57.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  34.02 
 
 
1127 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  30 
 
 
917 aa  56.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  40 
 
 
878 aa  57  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.71 
 
 
723 aa  54.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.73 
 
 
711 aa  53.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  27.27 
 
 
664 aa  53.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  29.49 
 
 
917 aa  53.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  43.28 
 
 
94 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  30.99 
 
 
1180 aa  52.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  41.79 
 
 
880 aa  52.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  30.7 
 
 
1153 aa  52  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  31.58 
 
 
1155 aa  51.6  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  35.82 
 
 
870 aa  51.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  27.14 
 
 
1152 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  29.58 
 
 
1152 aa  51.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  27.98 
 
 
1158 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.47 
 
 
873 aa  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  27.72 
 
 
1137 aa  50.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.18 
 
 
875 aa  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  28.38 
 
 
1153 aa  49.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  33.72 
 
 
901 aa  48.5  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  31.65 
 
 
617 aa  47.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  28.89 
 
 
1194 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  33.33 
 
 
875 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  28.28 
 
 
918 aa  47  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  29.06 
 
 
875 aa  46.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  25.22 
 
 
880 aa  46.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  37.65 
 
 
874 aa  45.8  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  37.14 
 
 
885 aa  45.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>