84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3042 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 880 aa  1726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  42.6 
 
 		 878 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  36.04 
 
 		 875 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  36.07 
 
 		 874 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  36.09 
 
 		 874 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  34.37 
 
 		 878 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  29.16 
 
 		 880 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.09 
 
 		 875 aa  213  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.28 
 
 		 873 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  29.38 
 
 		 875 aa  173  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  25.22 
 
 		 901 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  38.74 
 
 		 880 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  27.19 
 
 		 892 aa  105  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  42.62 
 
 		 881 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  33.22 
 
 		 888 aa  91.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  28.74 
 
 		 870 aa  84.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  26.98 
 
 		 917 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  30.97 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  30.97 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  30.97 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  37.32 
 
 		 877 aa  66.6  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  37.41 
 
 		 883 aa  67  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  35.21 
 
 		 885 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  28 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1351 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  31.71 
 
 		 875 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  30.56 
 
 		 1171 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  45.45 
 
 		 712 aa  55.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.25 
 
 		 918 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  30.08 
 
 		 821 aa  55.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  28.09 
 
 		 883 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  42.42 
 
 		 968 aa  53.5  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1282 aa  53.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1284 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  39.71 
 
 		 1179 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  33.33 
 
 		 910 aa  52.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1354 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1065 aa  51.2  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  32.73 
 
 		 1163 aa  51.2  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  32.84 
 
 		 922 aa  51.2  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1185 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 1061 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.89 
 
 		 830 aa  50.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1051 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  42.67 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  31.34 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.87 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  42.67 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  31.52 
 
 		 818 aa  49.3  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  41.33 
 
 		 1199 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  41.33 
 
 		 1198 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1348 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  33.82 
 
 		 617 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  35.29 
 
 		 1167 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1467 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  37.33 
 
 		 1178 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  34.85 
 
 		 729 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1414 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1194 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  44.64 
 
 		 1184 aa  46.2  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.3 
 
 		 664 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  32.93 
 
 		 978 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  44.44 
 
 		 1115 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  32.93 
 
 		 978 aa  45.8  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  40 
 
 		 812 aa  45.8  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  34.94 
 
 		 1176 aa  45.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  27.32 
 
 		 1185 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1190 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  27.52 
 
 		 815 aa  45.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1155 aa  45.1  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1138 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1157 aa  44.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  30.49 
 
 		 979 aa  45.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  32 
 
 		 483 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  31.11 
 
 		 1208 aa  44.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  44 
 
 		 1511 aa  44.3  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 		 1142 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.56 
 
 		 1190 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1153 aa  44.3  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  38.81 
 
 		 1142 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>