92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1053 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  47.39 
 
 
1171 aa  976    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  41.07 
 
 
1210 aa  755    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  100 
 
 
1167 aa  2301    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  35.2 
 
 
1163 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  28.71 
 
 
1186 aa  357  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.03 
 
 
1160 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  28.18 
 
 
1181 aa  286  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  28.8 
 
 
1155 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  26.12 
 
 
1185 aa  281  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  28.25 
 
 
1156 aa  268  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  30.28 
 
 
1151 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  27.87 
 
 
1156 aa  260  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  30.57 
 
 
1152 aa  260  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  29.65 
 
 
1152 aa  255  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  27.01 
 
 
1153 aa  243  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  26.18 
 
 
1153 aa  211  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  34.79 
 
 
1167 aa  168  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  27.2 
 
 
1156 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  28 
 
 
1156 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  29.73 
 
 
1158 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  36.02 
 
 
1157 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  31.1 
 
 
1156 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  27.67 
 
 
1179 aa  154  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  36.3 
 
 
1156 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  36.3 
 
 
1156 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  26.73 
 
 
1155 aa  144  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  37.72 
 
 
1149 aa  142  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  31.35 
 
 
1144 aa  142  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  30 
 
 
1127 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  41.81 
 
 
1126 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  34.75 
 
 
1126 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  40.74 
 
 
1181 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  26.54 
 
 
1157 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  28.94 
 
 
1153 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  39.46 
 
 
188 aa  115  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  38.83 
 
 
1201 aa  104  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  33.21 
 
 
1348 aa  99.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  25.26 
 
 
1354 aa  92  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  25.34 
 
 
1047 aa  89.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  31.96 
 
 
1277 aa  88.2  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  23.4 
 
 
1351 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  25.76 
 
 
830 aa  87  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  24.64 
 
 
1280 aa  80.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  32.12 
 
 
1282 aa  77.4  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  27.18 
 
 
787 aa  77  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.5 
 
 
723 aa  75.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  24.11 
 
 
1284 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  22.78 
 
 
1065 aa  73.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  31.79 
 
 
968 aa  73.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.43 
 
 
664 aa  72.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  22.17 
 
 
974 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  36.04 
 
 
1467 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  21.93 
 
 
974 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  31.64 
 
 
812 aa  70.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  20.89 
 
 
974 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  21.69 
 
 
974 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  21.53 
 
 
974 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  21.45 
 
 
877 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  21.2 
 
 
974 aa  67.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  36.04 
 
 
1414 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  27.85 
 
 
922 aa  66.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.52 
 
 
724 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  30.5 
 
 
729 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  27.22 
 
 
922 aa  63.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  19.76 
 
 
974 aa  62.4  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  24.77 
 
 
767 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  24.77 
 
 
767 aa  62  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  33.04 
 
 
883 aa  60.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  33.63 
 
 
711 aa  58.9  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  33.96 
 
 
821 aa  58.5  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  46.3 
 
 
712 aa  58.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  23.35 
 
 
979 aa  57.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  38.1 
 
 
1194 aa  58.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  22.57 
 
 
973 aa  57  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  22.16 
 
 
978 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  22.16 
 
 
978 aa  56.6  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  29.27 
 
 
768 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  51.92 
 
 
917 aa  53.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  33.9 
 
 
1137 aa  53.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  36.47 
 
 
1180 aa  50.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  26.05 
 
 
199 aa  48.5  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  36.05 
 
 
885 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  26.05 
 
 
199 aa  48.5  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  32.1 
 
 
873 aa  48.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  33.75 
 
 
875 aa  48.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  32.93 
 
 
817 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.29 
 
 
880 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  29.75 
 
 
1047 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  32.88 
 
 
818 aa  45.8  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  26.73 
 
 
875 aa  45.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  25.78 
 
 
890 aa  45.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>