162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5376 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  91.3 
 
 		 874 aa  1529    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  46.92 
 
 		 878 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  100 
 
 		 874 aa  1706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  36.29 
 
 		 878 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  35.13 
 
 		 880 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  34.18 
 
 		 875 aa  379  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  30.36 
 
 		 880 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  26.41 
 
 		 873 aa  122  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  30.65 
 
 		 875 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  25.37 
 
 		 892 aa  97.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  35.23 
 
 		 901 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  30.14 
 
 		 875 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  36.67 
 
 		 877 aa  90.1  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  42.28 
 
 		 888 aa  89  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  40.19 
 
 		 881 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  40.16 
 
 		 870 aa  74.3  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  31.16 
 
 		 917 aa  68.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1938  SMC domain protein  26.48 
 
 		 946 aa  63.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1354 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  41.43 
 
 		 1351 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  32.17 
 
 		 1189 aa  58.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 712 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  31.17 
 
 		 910 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1201 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  30.08 
 
 		 874 aa  56.2  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1284 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  36.08 
 
 		 1184 aa  55.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.91 
 
 		 918 aa  55.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1198 aa  55.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  36.28 
 
 		 1190 aa  55.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1213 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  32.43 
 
 		 1185 aa  53.5  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1222 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  25.71 
 
 		 917 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  27.97 
 
 		 1200 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1172 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  26.95 
 
 		 968 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  35.65 
 
 		 1174 aa  52.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1198 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1195 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1184 aa  52.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1181 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  34.93 
 
 		 883 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1367  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 		 1186 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.803555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 		 1218 aa  52  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1191 aa  52  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.68 
 
 		 729 aa  51.6  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  30.33 
 
 		 912 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  40.28 
 
 		 359 aa  51.2  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  28.95 
 
 		 1188 aa  51.2  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  31.86 
 
 		 1192 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  28.32 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1203 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  30.09 
 
 		 1188 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  34.21 
 
 		 1187 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1263 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  37.74 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  36.13 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 		 1227 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.09 
 
 		 1196 aa  50.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  36.26 
 
 		 1148 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1176 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  29.03 
 
 		 1187 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  24.28 
 
 		 812 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  34.45 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 		 1191 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1188 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  24.24 
 
 		 1191 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.21 
 
 		 370 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  23.44 
 
 		 617 aa  48.5  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.63 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  31.86 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  36.56 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  31.4 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  38.2 
 
 		 1152 aa  48.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  27.43 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1222 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  29.31 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1047 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1195 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.2 
 
 		 1178 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1195 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  34.02 
 
 		 1134 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  27.43 
 
 		 1195 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1065 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 		 1187 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1185 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 		 1144 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  28.32 
 
 		 1225 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  34.78 
 
 		 1171 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  29.89 
 
 		 1214 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  28.74 
 
 		 1217 aa  47  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>