101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1266 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  100 
 
 
830 aa  1686    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  28.95 
 
 
787 aa  258  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  25.79 
 
 
821 aa  231  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  27.63 
 
 
812 aa  203  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  34.14 
 
 
974 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  34.14 
 
 
974 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1085  hypothetical protein  34.14 
 
 
877 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0002900000000001e-55 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  33.73 
 
 
974 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  33.73 
 
 
974 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  33.73 
 
 
974 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  134  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 
973 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  32.56 
 
 
974 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  29.8 
 
 
1284 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  28.63 
 
 
1280 aa  115  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0944  hypothetical protein  34.31 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1009  hypothetical protein  34.31 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  32.38 
 
 
1065 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  26.65 
 
 
978 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  26.65 
 
 
978 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  30.59 
 
 
979 aa  99.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  27.36 
 
 
1282 aa  99  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  32.37 
 
 
1351 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.6 
 
 
1354 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  37.43 
 
 
767 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  37.43 
 
 
767 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2311  hypothetical protein  27.91 
 
 
1414 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  44.86 
 
 
664 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  25.76 
 
 
1167 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  32.1 
 
 
1153 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  28.74 
 
 
1163 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  39.36 
 
 
922 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  38.68 
 
 
1194 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  30.88 
 
 
1181 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  29.02 
 
 
1467 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  38.3 
 
 
922 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  28.91 
 
 
1149 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  30.18 
 
 
711 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  29 
 
 
1047 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.08 
 
 
1171 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  29.23 
 
 
1210 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  30.99 
 
 
1160 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  37.78 
 
 
617 aa  70.5  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  25 
 
 
1167 aa  70.1  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  25.66 
 
 
1153 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  35 
 
 
1186 aa  70.1  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  27.75 
 
 
1157 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  24.73 
 
 
1144 aa  66.6  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  23.46 
 
 
1185 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  30 
 
 
1157 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  31.94 
 
 
768 aa  64.7  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1036  hypothetical protein  36.61 
 
 
890 aa  64.7  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0074125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.05 
 
 
729 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  30.56 
 
 
1348 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0829  hypothetical protein  41.89 
 
 
817 aa  62.4  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.962006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  28.32 
 
 
883 aa  61.6  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  26.84 
 
 
1201 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  23.24 
 
 
1179 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  23.2 
 
 
935 aa  58.9  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0162  hypothetical protein  24.12 
 
 
1181 aa  58.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512119  normal  0.189121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.05 
 
 
723 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  29.41 
 
 
1156 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  30.17 
 
 
1156 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  29.69 
 
 
1156 aa  55.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  29.69 
 
 
1156 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  29.69 
 
 
1156 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  31.97 
 
 
1155 aa  54.3  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3628  hypothetical protein  25.3 
 
 
1151 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684828  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  36.49 
 
 
758 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  36.49 
 
 
758 aa  53.9  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  30.17 
 
 
1156 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  39.73 
 
 
968 aa  53.9  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  37.14 
 
 
1153 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  36.63 
 
 
901 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1186  hypothetical protein  26.92 
 
 
1152 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0481  hypothetical protein  32.93 
 
 
818 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  26.4 
 
 
1156 aa  53.5  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 
917 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  27.94 
 
 
1126 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0347  hypothetical protein  25.5 
 
 
1127 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  28.93 
 
 
1277 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  27.94 
 
 
1126 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  30.89 
 
 
880 aa  50.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  27.27 
 
 
712 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  27.75 
 
 
955 aa  50.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.63 
 
 
724 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  29.09 
 
 
1158 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  35.29 
 
 
870 aa  49.3  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2830  hypothetical protein  25.95 
 
 
1152 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0725  hypothetical protein  22.53 
 
 
1158 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  38.24 
 
 
883 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  33.33 
 
 
873 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  34.85 
 
 
885 aa  45.8  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
702 aa  45.8  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0897  hypothetical protein  28.44 
 
 
798 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.558915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  34.15 
 
 
875 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0421  hypothetical protein  32.61 
 
 
719 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  27.03 
 
 
1180 aa  45.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7590  hypothetical protein  22.7 
 
 
1153 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556339  normal  0.8544 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>