54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3237 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  100 
 
 
1158 aa  2320    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1256  hypothetical protein  26.83 
 
 
1153 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537962  normal  0.251467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  27.55 
 
 
1137 aa  282  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  28.03 
 
 
1180 aa  263  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  23 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  28.64 
 
 
812 aa  69.7  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  24.5 
 
 
974 aa  64.3  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  23.91 
 
 
974 aa  61.6  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  30.19 
 
 
883 aa  61.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  23.5 
 
 
974 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  22.88 
 
 
1284 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  24.47 
 
 
978 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  24.47 
 
 
978 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  24.46 
 
 
974 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  22.89 
 
 
1065 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  23.5 
 
 
974 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  30.11 
 
 
1153 aa  59.7  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  23 
 
 
974 aa  59.3  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  30.71 
 
 
1354 aa  58.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  23.5 
 
 
968 aa  58.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  27 
 
 
1351 aa  58.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  23.37 
 
 
974 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  26.97 
 
 
787 aa  57  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  23.91 
 
 
767 aa  56.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  23.91 
 
 
767 aa  56.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  21.75 
 
 
979 aa  55.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  30.21 
 
 
729 aa  53.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  28.24 
 
 
1156 aa  53.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  27.92 
 
 
1185 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  28.64 
 
 
1156 aa  52  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  29.17 
 
 
1282 aa  52  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.47 
 
 
922 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  28.57 
 
 
1179 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  27.31 
 
 
1156 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  21.5 
 
 
973 aa  51.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  28.44 
 
 
1156 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0879  hypothetical protein  28.22 
 
 
1153 aa  50.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  26.85 
 
 
1156 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 
917 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  29.02 
 
 
840 aa  50.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  29.09 
 
 
830 aa  49.7  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  26.85 
 
 
1156 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  26.47 
 
 
922 aa  49.7  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  26.85 
 
 
1156 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  32 
 
 
870 aa  49.3  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3954  hypothetical protein  26.32 
 
 
1126 aa  49.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573007 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3215  hypothetical protein  27.33 
 
 
1126 aa  48.5  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  35.66 
 
 
1047 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0903  DNA repair ATPase  23.22 
 
 
821 aa  48.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.322396  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  38.57 
 
 
1171 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2341  hypothetical protein  23.63 
 
 
1186 aa  47.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98533  hitchhiker  0.0033945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  26.09 
 
 
1157 aa  47  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  24.92 
 
 
1280 aa  46.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  28.4 
 
 
1167 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>