126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1224    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  44.46 
 
 
602 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  25.16 
 
 
583 aa  153  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.4 
 
 
580 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  24.39 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  24.04 
 
 
565 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  23.75 
 
 
571 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  84  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  22.02 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  28.29 
 
 
680 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  32.64 
 
 
591 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  22.45 
 
 
572 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  26.24 
 
 
581 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  24.49 
 
 
593 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.43 
 
 
597 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30.46 
 
 
584 aa  54.3  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  22.5 
 
 
643 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  35.71 
 
 
364 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.83 
 
 
623 aa  51.2  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  45.45 
 
 
1277 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  23.08 
 
 
556 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  34.69 
 
 
451 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  33.7 
 
 
457 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.22 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  27.78 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  40 
 
 
712 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  22.46 
 
 
634 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.85 
 
 
379 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  22.22 
 
 
260 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  39.39 
 
 
912 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  30.11 
 
 
441 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  26.03 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  24.34 
 
 
539 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.72 
 
 
573 aa  47.8  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
355 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0234379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  25.35 
 
 
654 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 
394 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1954  ABC transporter related  25.61 
 
 
283 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  24.24 
 
 
606 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  28.99 
 
 
547 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  28.57 
 
 
486 aa  47.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  35.29 
 
 
302 aa  47.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 
385 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7459  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  21.51 
 
 
324 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  37.31 
 
 
543 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.48 
 
 
322 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000380465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  23.71 
 
 
562 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  31.33 
 
 
987 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 
238 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.65 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  33.02 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  27.72 
 
 
550 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  45.65 
 
 
1061 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  41.86 
 
 
398 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  27.91 
 
 
276 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  36.51 
 
 
239 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  33.7 
 
 
343 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  35.82 
 
 
237 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  36.62 
 
 
263 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2350  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
334 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  23.62 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  39.66 
 
 
571 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3932  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  23.39 
 
 
628 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  31.33 
 
 
987 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  28.15 
 
 
451 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  38.46 
 
 
385 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  25.74 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  35.82 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  25.84 
 
 
565 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
343 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.08 
 
 
628 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  30.12 
 
 
566 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  31.31 
 
 
257 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  29.03 
 
 
244 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  31.94 
 
 
448 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  36.67 
 
 
557 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  29.63 
 
 
419 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  34.67 
 
 
277 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  44.19 
 
 
564 aa  45.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 
793 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  37.25 
 
 
374 aa  45.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0018  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
332 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  36.49 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  37.1 
 
 
253 aa  45.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  26.95 
 
 
560 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1893  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.88 
 
 
322 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000746649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  36.84 
 
 
625 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  34.15 
 
 
547 aa  44.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1192  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.52 
 
 
357 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  36.67 
 
 
557 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  36 
 
 
238 aa  44.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.51 
 
 
736 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  32.14 
 
 
276 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  25.24 
 
 
591 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  25 
 
 
368 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.71 
 
 
613 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4323  ABC transporter related protein  24.23 
 
 
507 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  40 
 
 
875 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.67 
 
 
652 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>