55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2377 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1156    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  41.65 
 
 		 580 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2374  hypothetical protein  38.54 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 709 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  33.33 
 
 		 813 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  35.71 
 
 		 987 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.5 
 
 		 370 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  28.41 
 
 		 864 aa  50.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1403 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  38.57 
 
 		 804 aa  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  32.38 
 
 		 808 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  34.52 
 
 		 987 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  34.94 
 
 		 891 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  38.98 
 
 		 373 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 852 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 852 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.15 
 
 		 634 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  31.17 
 
 		 1019 aa  47  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3310  SMC domain protein  24.83 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 812 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  30.49 
 
 		 814 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.25 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  36.9 
 
 		 890 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  40.3 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  37.29 
 
 		 379 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  43.48 
 
 		 1003 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  40.32 
 
 		 378 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  30.77 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  42.22 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  44.9 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  41.18 
 
 		 1059 aa  45.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  40.98 
 
 		 604 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  34.18 
 
 		 924 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  32.35 
 
 		 1125 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  41.51 
 
 		 363 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.48 
 
 		 615 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  30.08 
 
 		 687 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  32.91 
 
 		 1021 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  40.91 
 
 		 405 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0690  hypothetical protein  38.46 
 
 		 550 aa  44.3  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.372164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  32.26 
 
 		 355 aa  44.3  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1587  hypothetical protein  38.46 
 
 		 550 aa  44.3  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.820969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  40.35 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  46.94 
 
 		 874 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1176 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  36.36 
 
 		 885 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  34.29 
 
 		 1176 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  30.69 
 
 		 423 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  33.33 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  42.86 
 
 		 573 aa  43.5  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  34.62 
 
 		 357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  34.62 
 
 		 357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  34.62 
 
 		 357 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>