72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2354 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1150    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  51.24 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  51.24 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  26.33 
 
 		 533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  24.92 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  25.47 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  24.4 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00630  hypothetical protein  27.14 
 
 		 535 aa  87.8  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0944683  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.41 
 
 		 594 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  23.01 
 
 		 520 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.9 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  25.53 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.16 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.14 
 
 		 640 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  21.13 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.74 
 
 		 613 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.27 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.12 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.01 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.79 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.54 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  21.74 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.22 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  23.15 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  21.97 
 
 		 763 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  26.52 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.55 
 
 		 793 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.51 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  22.81 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.16 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  29.17 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  21.08 
 
 		 594 aa  57  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  28 
 
 		 703 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.72 
 
 		 669 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  22.76 
 
 		 728 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  29.52 
 
 		 807 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  22.36 
 
 		 714 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  26.06 
 
 		 580 aa  53.9  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.71 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  23.11 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.97 
 
 		 688 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.38 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  22.11 
 
 		 543 aa  51.6  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  25.45 
 
 		 682 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.15 
 
 		 677 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.15 
 
 		 677 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.41 
 
 		 596 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  26.35 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  22.39 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.6 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.85 
 
 		 659 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  26.11 
 
 		 773 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.4 
 
 		 762 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.57 
 
 		 608 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  50 
 
 		 392 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  43.4 
 
 		 362 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  20.95 
 
 		 397 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  26.49 
 
 		 634 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  26.92 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.47 
 
 		 652 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.62 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  26.98 
 
 		 769 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  24.29 
 
 		 784 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.2 
 
 		 707 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  22.08 
 
 		 583 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  25.19 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  31.51 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  36.96 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  25.14 
 
 		 748 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  21.94 
 
 		 667 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  37.88 
 
 		 712 aa  43.5  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>