89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4173 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 583 aa  1207    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  70.94 
 
 		 580 aa  879    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  29.31 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  26.92 
 
 		 565 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  26.5 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  25.16 
 
 		 595 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  28.74 
 
 		 347 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  26.75 
 
 		 378 aa  124  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  24.29 
 
 		 602 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  27.61 
 
 		 680 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  24.78 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  28.09 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  22.86 
 
 		 591 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  20.86 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  24.93 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  30.82 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.23 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.28 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  20.16 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  32.43 
 
 		 428 aa  53.9  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.07 
 
 		 652 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.71 
 
 		 548 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  21.4 
 
 		 391 aa  50.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1099  ABC transporter related  30.88 
 
 		 274 aa  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  hitchhiker  0.000176016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.79 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  41.38 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.38 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  40.51 
 
 		 241 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  41.38 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1444  ATPase  37.5 
 
 		 237 aa  48.5  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3919  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.76 
 
 		 337 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.23 
 
 		 584 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  26.09 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.59 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  38.1 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0082  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 367 aa  47  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0024  ABC transporter related  39.68 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  34.48 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  44.19 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  37.93 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  34.48 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  32.43 
 
 		 238 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  22.08 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.9 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  37.93 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  37.93 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  29.79 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0807  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 236 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.147643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  32.97 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5570  ABC transporter related  29.46 
 
 		 239 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0010719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  26.27 
 
 		 466 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.76 
 
 		 326 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_004310  BR1583  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.48 
 
 		 282 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282414  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  29.69 
 
 		 658 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  35.44 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  45.24 
 
 		 604 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  36.21 
 
 		 249 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  36.21 
 
 		 571 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.77 
 
 		 277 aa  44.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 361 aa  44.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  39.34 
 
 		 486 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1381  ABC transporter related  39.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.044144  normal  0.0317501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  45.45 
 
 		 628 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.06 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  32.08 
 
 		 261 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  26.96 
 
 		 457 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  36.21 
 
 		 573 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 		 354 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.71 
 
 		 353 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  40.62 
 
 		 249 aa  44.3  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 		 334 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  32.84 
 
 		 250 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  25.5 
 
 		 261 aa  43.9  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  26.87 
 
 		 597 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 		 324 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  29.36 
 
 		 586 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  32.99 
 
 		 274 aa  43.9  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  27.14 
 
 		 418 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32 
 
 		 275 aa  43.9  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 557 aa  43.5  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  37.93 
 
 		 505 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1585  ABC transporter related  32.76 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1528  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  32.26 
 
 		 365 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>