More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5181 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  68.47 
 
 		 547 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  78.88 
 
 		 572 aa  872    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  63.72 
 
 		 597 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 578 aa  1161    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  48.49 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  49.54 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  47.33 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  47.15 
 
 		 561 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  48.79 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 565 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.38 
 
 		 547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  46.77 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  46.65 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.19 
 
 		 583 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 573 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  44.1 
 
 		 597 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  42.98 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  45.16 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  45.94 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.89 
 
 		 661 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.38 
 
 		 643 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  42.96 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.94 
 
 		 573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.75 
 
 		 584 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  45.47 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  43.14 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  44.49 
 
 		 538 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  47.28 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  40 
 
 		 615 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  45.94 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  40.54 
 
 		 599 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  41.83 
 
 		 619 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  40.81 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.34 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  41.86 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.35 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  41.95 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  39.89 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  40 
 
 		 629 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.07 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4592  ABC transporter related  40.07 
 
 		 629 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390249  normal  0.807513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  41.13 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 548 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.69 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  39.83 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  40.41 
 
 		 624 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.39 
 
 		 612 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 623 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  43.26 
 
 		 539 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.42 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  42.32 
 
 		 606 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  43.54 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  38.69 
 
 		 627 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0090  oligopeptide transport ATP-binding protein  39.85 
 
 		 530 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  41.48 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  40.41 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.49 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  39.29 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.59 
 
 		 592 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.38 
 
 		 611 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  41.32 
 
 		 549 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  38.74 
 
 		 609 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  41.8 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.06 
 
 		 617 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  40.71 
 
 		 592 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  45.25 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 		 625 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.75 
 
 		 564 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  41.36 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.07 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.8 
 
 		 599 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  40.93 
 
 		 613 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  39.46 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.97 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  39.15 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  41.14 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  39.42 
 
 		 593 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.89 
 
 		 633 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  42.34 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  39.02 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  42.34 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  41.37 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  41.03 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  39.65 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.41 
 
 		 629 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  41.2 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  38.1 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  38.35 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  39.74 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  39.28 
 
 		 624 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  41.56 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  39.45 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.65 
 
 		 625 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>