60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0282 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  100 
 
 		 378 aa  778    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  39.41 
 
 		 571 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  39.41 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  32.81 
 
 		 573 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  32.98 
 
 		 565 aa  189  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  26.32 
 
 		 580 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  26.75 
 
 		 583 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  22.02 
 
 		 595 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  24.31 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  21.89 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  23.51 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 572 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.07 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  31.31 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2127  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  26.88 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  40.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  40.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  40.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  40.68 
 
 		 223 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  40 
 
 		 269 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  22.8 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1021  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.82 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2632  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.76 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.174324  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  52.27 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5789  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.47 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.7 
 
 		 669 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  26.88 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  29.66 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0884  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  25.81 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.892732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.12 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00129918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  27.5 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0401  ABC transporter related  26.88 
 
 		 311 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0476  peptide transport system ATP-binding protein SapD  25.29 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3948  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  22.92 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0129  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  25.81 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  28.43 
 
 		 624 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3856  DL-methionine transporter subunit  35.94 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.17 
 
 		 584 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  27.93 
 
 		 441 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  26.88 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.73 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  28.04 
 
 		 629 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  32.91 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.88 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496309  normal  0.0441332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2851  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.94 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2121  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.47 
 
 		 611 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21840  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908882  normal  0.0444961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0907  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  26.88 
 
 		 318 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000823752  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0118  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.96 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  26.83 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  27.18 
 
 		 557 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  25.81 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.326144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.44 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>