71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5503 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  100 
 
 		 464 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  46.01 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  32.05 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.94 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  26.53 
 
 		 769 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  25.85 
 
 		 420 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  25.89 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.89 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.4 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.07 
 
 		 709 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.88 
 
 		 736 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  31.96 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  33.54 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  24.93 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.39 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.74 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  31.37 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  37.5 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  29.34 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.06 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  38.46 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  31.61 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.74 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  23.31 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.28 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  31.34 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  40.66 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  36.63 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  28.71 
 
 		 577 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  27.08 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.47 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  38.64 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  33.03 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0394  putative ATP-binding protein  42.5 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  32 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  22.76 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 429 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  24.32 
 
 		 369 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  36.04 
 
 		 610 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  25.27 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  29.7 
 
 		 677 aa  50.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  47.83 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  27.78 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  33 
 
 		 1346 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  38.33 
 
 		 608 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  30.56 
 
 		 673 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 1230 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2562  hypothetical protein  24.35 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  42.19 
 
 		 888 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  38.18 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  26.85 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  42.37 
 
 		 680 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  20.96 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  34.31 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  28.57 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  34 
 
 		 1227 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  40.91 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  37.1 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30.77 
 
 		 976 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  34.48 
 
 		 1227 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  36.84 
 
 		 712 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  32.56 
 
 		 1247 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.57 
 
 		 676 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.07 
 
 		 650 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  27.66 
 
 		 1190 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 852 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 852 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>