50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2832 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  100 
 
 		 580 aa  1207    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  70.94 
 
 		 583 aa  859    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  30.16 
 
 		 571 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  25.82 
 
 		 573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  26.07 
 
 		 565 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.4 
 
 		 595 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  27.84 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  26.32 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  24.86 
 
 		 602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  24.46 
 
 		 572 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  24.88 
 
 		 680 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  23.09 
 
 		 634 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.48 
 
 		 708 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  24.64 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  25.35 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.58 
 
 		 584 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  26.06 
 
 		 565 aa  54.3  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.04 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  24.37 
 
 		 591 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  22.07 
 
 		 566 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  27.12 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  41.38 
 
 		 369 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5288  SMC domain protein  26.96 
 
 		 610 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.54 
 
 		 573 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.76 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.84 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.63 
 
 		 634 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  36.59 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.25 
 
 		 628 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.01 
 
 		 597 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  39.66 
 
 		 547 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  25.76 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.66 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  38.81 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  28.32 
 
 		 658 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  26.32 
 
 		 565 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2206  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.77 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000504054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  24.54 
 
 		 505 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  29.17 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  25.38 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  22.25 
 
 		 522 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  21.97 
 
 		 650 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  29.85 
 
 		 232 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  35.94 
 
 		 536 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  29.93 
 
 		 591 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  36.11 
 
 		 595 aa  43.9  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  37.5 
 
 		 529 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  31.43 
 
 		 563 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  37.93 
 
 		 542 aa  43.9  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>