65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0641 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  100 
 
 		 418 aa  860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  27.75 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  34.1 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  23.84 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  24.83 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  32.54 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.7 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  30.68 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  29.76 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.15 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.93 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  24.26 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  38.04 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  37.63 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  24.29 
 
 		 455 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  35 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  25.38 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  34.65 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.2 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.02 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  41.03 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.93 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  27.08 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  25.51 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.56 
 
 		 736 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  23.82 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  25.4 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  23.17 
 
 		 769 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  36.25 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  31.07 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  41.33 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  28.36 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  35 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  22.28 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.92 
 
 		 976 aa  60.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.95 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  29.29 
 
 		 709 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  34.12 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  54.35 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  22.97 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  27.92 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  28.89 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  24.08 
 
 		 540 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  29.52 
 
 		 577 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  23.57 
 
 		 461 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  26.34 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  21.85 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  27.08 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  31.62 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  31.25 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  31.15 
 
 		 708 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  31.07 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  26.07 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  39.66 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  26.7 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  24.58 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  33.68 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  41.18 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  25.38 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  32.67 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  36.71 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.43 
 
 		 532 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  27.14 
 
 		 583 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  37.68 
 
 		 623 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3483  zinc/manganese/iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  hitchhiker  0.00782648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>