104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1288 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  100 
 
 
417 aa  851    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  47.26 
 
 
419 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  46.82 
 
 
419 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  47.51 
 
 
418 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  61.63 
 
 
187 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  30.93 
 
 
450 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  26.4 
 
 
454 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  28.02 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.3 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.68 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.7 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  24.23 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  23.48 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.81 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  22.85 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.64 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.87 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.59 
 
 
368 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.35 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.38 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.38 
 
 
367 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.07 
 
 
367 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.07 
 
 
367 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  23.29 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  34.82 
 
 
377 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 
378 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  21.89 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  22.2 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.9 
 
 
364 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.22 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.86 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2290  hypothetical protein  21.29 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18336  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.8 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  23.43 
 
 
378 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  21.71 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  22.67 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  28 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  23.74 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  54.55 
 
 
1189 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 
1189 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 
1189 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  54.55 
 
 
1189 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  29.85 
 
 
412 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.42 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.15 
 
 
226 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.05 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.05 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  27.91 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  23.33 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.71 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  21.49 
 
 
429 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  37.04 
 
 
490 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  21 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  33.08 
 
 
373 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  52.27 
 
 
1191 aa  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  29.57 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  21.24 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  21.07 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.17 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  29.82 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  28.81 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  29.94 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  29.94 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  22.16 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  23.36 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  28.33 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  27.52 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  26.13 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  20.71 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.2 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  20.71 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  21.47 
 
 
365 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  45.45 
 
 
131 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  22.91 
 
 
369 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  30.77 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  27.78 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  33.59 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  24.3 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  37.68 
 
 
1174 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  22.11 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  29.27 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  32.89 
 
 
659 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  21.96 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  34.09 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  37.14 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  37.14 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  21.47 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  22.19 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  25.38 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  23.08 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.56 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  36.54 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  21.89 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  45.45 
 
 
131 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 
1198 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  33.82 
 
 
1198 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 
1179 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.07 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  36.49 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>