39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0943 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1151    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0618  hypothetical protein  28.38 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.508373  normal  0.13002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  23.08 
 
 
556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.77 
 
 
564 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  53.9  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.7 
 
 
626 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  45.45 
 
 
363 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  30.56 
 
 
442 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  31.09 
 
 
378 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.62 
 
 
666 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  39.71 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  23.44 
 
 
533 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  29.79 
 
 
461 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.22 
 
 
639 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  27.68 
 
 
626 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  25.63 
 
 
661 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  23.42 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  24.31 
 
 
645 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  31.07 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  35.29 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 
574 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  35.06 
 
 
435 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  30.88 
 
 
224 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  40.35 
 
 
368 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  29.87 
 
 
582 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  28.71 
 
 
572 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  29.93 
 
 
285 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  37.33 
 
 
641 aa  44.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  34.43 
 
 
377 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  52.5 
 
 
573 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  31.07 
 
 
387 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  36.49 
 
 
540 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  33.73 
 
 
393 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  31.34 
 
 
369 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25.61 
 
 
410 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.35 
 
 
550 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  28.48 
 
 
595 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>