24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0681 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1263    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  31.2 
 
 
658 aa  276  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.19 
 
 
548 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  27.01 
 
 
585 aa  96.3  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  29.73 
 
 
566 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0932  hypothetical protein  21.8 
 
 
638 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  21.57 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.61 
 
 
529 aa  58.9  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.3 
 
 
652 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  25.52 
 
 
666 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.17 
 
 
708 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  24.65 
 
 
628 aa  51.2  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  24.19 
 
 
553 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25 
 
 
688 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.8 
 
 
613 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.66 
 
 
584 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  33.04 
 
 
457 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.79 
 
 
634 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  28.03 
 
 
445 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.05 
 
 
616 aa  44.3  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  25.14 
 
 
443 aa  44.3  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.91 
 
 
550 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  30.08 
 
 
497 aa  43.9  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>