47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3206 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  100 
 
 		 443 aa  895    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  33.33 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  36.09 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  34.75 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  33.05 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  31.68 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  32.58 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  30.74 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  29.49 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  45.83 
 
 		 94 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  22.13 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  36.47 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  39.53 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  37.5 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  32.91 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  33.04 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  35.29 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30.11 
 
 		 976 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  42.03 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  35.8 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.56 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  38.67 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  37.5 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  29.82 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  34.44 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  31.87 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  40.28 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  36.99 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  40.74 
 
 		 582 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.8 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  27.57 
 
 		 482 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  31.31 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.12 
 
 		 540 aa  46.6  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  33.33 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  41.18 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.6 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  33.71 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  33.33 
 
 		 545 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  39.74 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.11 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  37.5 
 
 		 567 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  25.14 
 
 		 619 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0808  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.81 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  42.86 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.69 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  38.27 
 
 		 643 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>