31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1796 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1393    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  29.85 
 
 
708 aa  253  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.5 
 
 
681 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  29.05 
 
 
654 aa  200  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  30.09 
 
 
591 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  30 
 
 
494 aa  187  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  26.9 
 
 
654 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.48 
 
 
672 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  24.45 
 
 
697 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.82 
 
 
614 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  27.69 
 
 
670 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  22.43 
 
 
641 aa  70.5  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  27.01 
 
 
771 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.48 
 
 
582 aa  63.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.89 
 
 
595 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.37 
 
 
708 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  23.94 
 
 
628 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.73 
 
 
642 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  30.22 
 
 
579 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  38.96 
 
 
666 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  36.46 
 
 
597 aa  48.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  34.02 
 
 
376 aa  47.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
495 aa  47.4  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  30.67 
 
 
663 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  38.24 
 
 
368 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42 
 
 
496 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  24.62 
 
 
584 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  31.73 
 
 
369 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  24.77 
 
 
660 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  38.1 
 
 
564 aa  43.9  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.75 
 
 
603 aa  43.9  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>