51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3672 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  779    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  33.42 
 
 
381 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  29.87 
 
 
356 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  29.85 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  31.22 
 
 
377 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  29.67 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  26.8 
 
 
345 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  37.16 
 
 
353 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  28.09 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  26.28 
 
 
399 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  26.28 
 
 
399 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  37.21 
 
 
350 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  23.06 
 
 
356 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  24.37 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  32.03 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  32.03 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  29.63 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  30.4 
 
 
366 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  26.02 
 
 
140 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  45.65 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.25 
 
 
584 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  24.34 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.5 
 
 
708 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 
634 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.72 
 
 
387 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  35.09 
 
 
513 aa  46.6  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  39.22 
 
 
538 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.78 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  39.22 
 
 
534 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  29.17 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  31.25 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  48.84 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  22.19 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2488  hypothetical protein  33.71 
 
 
464 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.11421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  24.89 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  22.16 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  39.66 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  22.25 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7429  ABC efflux pump, ATPase subunit  26.62 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0346135  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  20.71 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  36.96 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5655  ABC transporter related  26.62 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6020  ABC transporter related  26.62 
 
 
337 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.628016  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6511  ABC transporter related  25.9 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192543  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.67 
 
 
608 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  41.82 
 
 
497 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  41.86 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  21.79 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  44.19 
 
 
478 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 
373 aa  42.7  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>