23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3830 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1078    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  90.84 
 
 
538 aa  884    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2592  hypothetical protein  46.18 
 
 
429 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  42.59 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00444  recombination protein F  38.81 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002007  DNA recombination and repair protein RecF  38.81 
 
 
359 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0003677  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  40 
 
 
363 aa  50.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0011  recombination protein F  37.31 
 
 
359 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  39.22 
 
 
378 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  40 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  47.06 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 
359 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  47.06 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  35.09 
 
 
532 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.36 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  40 
 
 
396 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  30 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  32.47 
 
 
356 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  36.73 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  45.24 
 
 
361 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  45.24 
 
 
361 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0003  recombination protein F  45.24 
 
 
361 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>